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藻类与细菌形成动态的伙伴关系，塑造着多样化的生态系统。模式绿微藻莱茵衣藻（Chlamydomonas reinhardtii）常见于水稻田中，但其细菌伙伴的多样性和功能特征仍鲜为人知。本研究从水稻根际及其周围土壤中分离出12株细菌。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明，其中8株属于假单胞菌属（Pseudomonas）。3株假单胞菌根际菌株对莱茵衣藻表现出拮抗作用，对其生长、色素积累和细胞形态产生负面影响。在液体培养中，观察到这3株拮抗性假单胞菌与莱茵衣藻之间存在紧密的物理关联。全基因组测序鉴定出这3株拮抗菌分别为 Pseudomonas alloputida、Pseudomonas tohonis 和 Pseudomonas asiatica。3个细菌基因组均编码多种已知参与化学竞争的因子。值得注意的是，P. tohonis 携带一个编码酚类毒素2,4-二乙酰基间苯三酚（DAPG）的基因簇。DAPG可抑制莱茵衣藻生长并改变其细胞形态。这些发现拓展了我们对莱茵衣藻相关细菌伙伴多样性的认识，并凸显了水稻根际相关假单胞菌作为强效绿藻拮抗菌的作用。这些细菌携带多种常见功能性状，可对绿藻种群动态产生负面影响。
水稻根际中的化学战：多种假单胞菌拮抗绿藻衣藻 | bioRxiv
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水稻根际中的化学战：多种假单胞菌拮抗绿藻衣藻
Xiaoqi Yang、Prateek Shetty、Bhoomika Vajrangi、Inam Ul Haq、Maria Mittag
doi：https://doi.org/10.64898/2026.11.11.765871
Xiaoqi Yang¹
德国耶拿，07743，耶拿大学 Matthias Schleiden 遗传学、生物信息学与分子植物学研究所
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Prateek Shetty¹
德国耶拿，07743，耶拿大学 Matthias Schleiden 遗传学、生物信息学与分子植物学研究所
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Bhoomika Vajrangi¹
德国耶拿，07743，耶拿大学 Matthias Schleiden 遗传学、生物信息学与分子植物学研究所
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Inam Ul Haq¹
德国耶拿，07743，耶拿大学 Matthias Schleiden 遗传学、生物信息学与分子植物学研究所
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Maria Mittag²
德国耶拿，07743，耶拿大学 Matthias Schleiden 遗传学、生物信息学与分子植物学研究所；耶拿大学微观世界平衡卓越集群
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通讯作者：
m.mittag{at}uni-jena.de
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藻类与细菌构成动态的伙伴关系，塑造着多种生态系统。模式绿藻莱茵衣藻（*Chlamydomonas reinhardtii*）常见于水稻田，但其细菌伙伴的多样性及功能特征仍未得到充分探究。本研究从水稻根际及周围土壤中分离出 12 株细菌。基于 16S rRNA 基因序列的系统发育分析显示，其中 8 株属于假单胞菌属（*Pseudomonas*）。3 株假单胞菌根际分离株对莱茵衣藻表现出拮抗作用，负面影响其生长、色素组成和细胞形态。在液体培养中，观察到这 3 株拮抗性假单胞菌与莱茵衣藻之间存在紧密的物理关联。全基因组测序鉴定出这些拮抗菌株分别为 *Pseudomonas alloputida*、*Pseudomonas tohonis* 和 *Pseudomonas asiatica*。这 3 株细菌的基因组均编码多种已知可介导化学攻防作用的因子。值得注意的是，*P. tohonis* 携带一个编码酚类毒素 2,4-二乙酰基间苯三酚（DAPG）的基因簇。DAPG 可抑制莱茵衣藻生长并改变其细胞形态。这些发现拓展了我们对与莱茵衣藻相关的细菌伙伴多样性的认识，并凸显了水稻根际相关假单胞菌作为强效绿藻拮抗菌的作用。这些细菌携带多种常见功能性状，可对绿藻种群动态产生负面影响。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助信息
德国研究联合会（Deutsche Forschungsgemeinschaft），德国卓越计划……
策略 – EXC 2051 – 项目编号 390713860
中国科学院，
，博士后奖学金
版权
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发布于 2026 年 11 月 12 日。
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水稻根际中的化学战：多种
假单胞菌
拮抗绿藻
衣藻
Xiaoqi
Yang
，
Prateek
Shetty
，
Bhoomika
Vajrangi
，
Inam
Ul Haq
，
Maria
Mittag
bioRxiv
2026.11.11.765871；
doi：
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水稻根际中的化学战：多种
假单胞菌
拮抗绿藻
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Xiaoqi
Yang
，
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Shetty
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Vajrangi
，
Inam
Ul Haq
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2026.11.11.765871；
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关键词：水稻根际 · 假单胞菌 · 莱茵衣藻 · 藻菌拮抗 · 化学竞争 · 2,4-二乙酰基间苯三酚
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.11.11.765871v1?rss=1