整合建模揭示F-box蛋白的结构域间柔性

内容形式：摘要译文

F-box 蛋白是 SCF（Skp1-Cul1-F-box）泛素连接酶复合物的底物识别模块，在靶向蛋白质降解中发挥核心作用，使多种底物能够被选择性招募。F-box 蛋白具有共同的结构架构，即保守的锚定结构域与底物结合结构域相连。尽管 F-box 蛋白已得到广泛的结构表征，其潜在的构象动态仍缺乏深入认识。在此，我们采用整合建模方法，结合冷冻电镜结构、交联质谱（XL-MS）以及基于深度学习的构象集合预测，描绘 F-box 蛋白可采取的构象。分析结果表明，FBXL2 和 FBXL17 具有显著的结构域间柔性，使其在组装后的 SCF 和 CSN-SCF 复合物中能够采样广泛的构象。相比之下，其他 F-box 蛋白（包括 FBXL1 和 FBXO22）虽具有内在柔性，但其构象空间明显更窄。总之，本研究揭示，结构域间可塑性是 F-box 蛋白一种可调节的结构特征，可能影响其在 SCF 复合物中的功能多样性。

关键词：F-box蛋白 · 结构域间柔性 · SCF泛素连接酶 · 整合结构建模 · 交联质谱 · 构象集合预测

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.11.07.764542v1?rss=1