- 2 次围观
背景：环状 GMP-AMP 合成酶（cGAS）是一种胞质 DNA 传感器，也具有非经典的核内功能，包括在人类中抑制同源重组（HR）。而在裸鼹鼠（NMR）中，cGAS 通过依赖 FANCI-RAD50 的机制促进 HR；这种功能反转被认为归因于 C 端的四个氨基酸替换。目前尚不清楚这种功能分化是否反映在由一级序列推导的频谱特征中。方法：我们对来自 14 种哺乳动物的 cGAS 序列和来自 8 个物种的 FANCI 序列应用共振识别模型（RRM）。利用 EIIP 值将序列转换为数值序列，并通过离散傅里叶变换进行分析；通过逐点相乘各个功率谱生成共识谱。计算 cGAS 与 FANCI 在目标频率处的相位差，并分析主导共有频率处的频谱振幅与体重、寿命及寿命体重比之间的相关性。依据 Cosic 公式（{lambda} = 201/f_RRM），将 RRM 频率转换为电磁波长。结果：cGAS 共识谱包含四个显著峰（f = 0.0392、0.0765、0.2539、0.4229），其中 0.2539 为主峰。FANCI 的三个峰（0.04138、0.2479、0.4332）与 cGAS 的峰接近；cGAS 与 FANCI 的联合共识谱保留了 0.2539 和 0.04077 处的峰。f = 0.2539 处的频谱振幅与体重相关（r = 0.647，p < 0.05），也与寿命体重比相关（r = -0.677，p < 0.01）；NMR 的振幅最低。人类 cGAS-FANCI 的相位差为 3.1297 rad，与反相仅相差 0.0118 rad，符合 RRM 相互作用判据；NMR 的 cGAS-FANCI 配对相位差为 1.7319 rad，约为 {pi}/2，不符合该判据。判据。将主导频率换算后，预测波长为 792 nm（378.5 THz），处于近红外范围。该预测可在透明的脊椎动物模型中检验：斑马鱼能够响应近红外光，且据报道，γ 射线致死剂量照射前的红光预处理可提高斑马鱼胚胎的存活率。结论：RRM 在 cGAS 中识别出保守的光谱特征，这些特征与 cGAS-FANCI 关系相一致；主导频率处的振幅则随生活史性状而变化。相位分析不支持 NMR cGAS-FANCI 存在直接相互作用特征；这一阴性结果与染色质介导机制相符。跨物种相位比较提示，NMR FANCI 也可能参与这种独特的相互作用模式，而非仅由 NMR cGAS 参与。预测的 792 nm 波长提供了一个明确且易于实验检验的参数，可用于检验 RRM 得出的频率是否能够调节透明脊椎动物模型的辐射抗性。这些结果仅用于提出假说，仍需实验验证。
cGAS 的共振识别模型分析：保守的谱频率与裸鼹鼠中显著不同的相位特征 | bioRxiv
跳转至主要内容
首页
关于
投稿
提醒 / RSS
搜索关键词
高级搜索
最新结果
cGAS 的共振识别模型分析：保守的谱频率与裸鼹鼠中显著不同的相位特征
查看 ORCID 个人资料
Jose Luis
Hernandez-Caceres
，
Mayrim
Vega-Hernandez
，
查看 ORCID 个人资料
Jorge
Iglesias Fuster
，
Anna
Dorohova
，
Ivan
Padron-Diaz
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.30.762874
Jose Luis Hernandez-Caceres
1
1 古巴神经科学中心，哈瓦那，古巴；俄罗斯联邦莫斯科州杜布纳，联合核子研究所辐射生物学实验室；
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Jose Luis Hernandez-Caceres 的 ORCID 记录
通讯作者：
kacerjlh{at}gmail.com
Mayrim Vega-Hernandez
2
古巴神经科学中心，哈瓦那，古巴；
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Jorge Iglesias Fuster
3
古巴神经科学中心；
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Jorge Iglesias Fuster 的 ORCID 记录
Anna Dorohova
4
生物活性物质系，库班国立大学，俄罗斯克拉斯诺达尔 350040；俄罗斯科学院南方科学中心活体系统稳定同位素扩散问题实验室，俄罗斯顿河畔罗斯托夫 344006；
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Ivan Padron-Diaz
5
俄罗斯联邦莫斯科州杜布纳，联合核子研究所辐射生物学实验室
查找
Google 学术上的该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站搜索该作者
摘要
背景：环鸟苷酸-腺苷酸合成酶（cGAS）是一种胞质 DNA 感受器，在细胞核中还具有非经典功能，包括抑制人类同源重组（HR）。而在裸鼹鼠（NMR）中，cGAS 通过依赖 FANCI-RAD50 的机制促进 HR。这种功能反转被认为与其 C 端的四个氨基酸替换有关。这种功能分化是否反映在由一级序列推导出的光谱特征中，目前尚不清楚。
方法：我们对 14 种哺乳动物的 cGAS 序列和 8 个物种的 FANCI 序列应用共振识别模型（RRM）。利用 EIIP 值将序列转换为数值序列，并通过离散傅里叶变换进行分析；对各个功率谱逐点相乘，生成共识光谱。计算 cGAS 与 FANCI 在感兴趣频率处的相位差。对主导共有频率处的光谱振幅与体重、寿命以及寿命与体重之比进行相关性分析。根据 Cosic 公式（λ = 201/f_RRM），将 RRM 频率转换为电磁波长。
结果：cGAS 共识光谱包含四个显著峰值（f = 0.0392、0.0765、0.2539、0.4229），其中 0.2539 为主峰。FANCI 的三个峰值（0.04138、0.2479、0.4332）与 cGAS 的峰值接近；cGAS 与 FANCI 的联合共识光谱保留了 0.2539 和 0.04077 处的峰值。f = 0.2539 处的光谱振幅与体重呈正相关（r = 0.647，p < 0.05），与寿命和体重之比呈负相关（r = −0.677，p < 0.01）；裸鼹鼠的振幅最低。人类 cGAS-FANCI 的相位差为 3.1297 rad，与反相状态相差 0.0118 rad，
满足 RRM 相互作用判据；NMR cGAS-FANCI 配对的结果为 1.7319 rad，约为 π/2，不满足该判据。将主导频率换算后，得到预测波长为 792 nm（378.5 THz），处于近红外范围。该预测可在透明的脊椎动物模型中进行检验：斑马鱼会对近红外光产生响应，且已有研究报道，致死剂量伽马辐照前进行红光预处理可提高斑马鱼胚胎的存活率。
结论：RRM 在 cGAS 中识别出保守的频谱特征，与 cGAS-FANCI 关系相符；主导频率处的振幅则随生活史特征而变化。相位分析不支持 NMR cGAS-FANCI 存在直接相互作用特征，这一阴性结果与染色质介导的机制相一致。跨物种相位比较表明，可能参与这种独特相互作用模式的不只是 NMR cGAS，NMR FANCI 也可能发挥作用。预测的 792 nm 波长提供了一个明确且可通过实验检验的参数，可用于评估 RRM 推导的频率能否调节透明脊椎动物模型的辐射抗性。这些结果旨在提出假设，仍需实验验证。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
版权
本预印本的版权持有人为作者/资助方；其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
返回顶部
上一篇
下一篇
发布于 2026 年 11 月 3 日。
下载 PDF
电子邮件
感谢您有意帮助传播 bioRxiv 的内容。
注意：请求提供您的电子邮件地址，仅用于确认您是本文的发送者。
您的电子邮件地址
*
您的姓名
*
收件人
*
输入多个地址，使用英文逗号分隔。
cGAS 的谐振识别模型分析：保守的谱频率与裸鼹鼠特有的相位特征
您即将通过电子邮件发送以下内容
cGAS 的谐振识别模型分析：保守的谱频率与裸鼹鼠特有的相位特征
邮件主题
（您的姓名）向您转发了一篇 bioRxiv 网页
邮件正文
（您的姓名）认为您可能会对 bioRxiv 网站上的这篇文章感兴趣。
您的个人留言
验证码
此问题用于确认您是真实访客，以防止自动化垃圾信息提交。
分享
cGAS 的谐振识别模型分析：保守的谱频率与裸鼹鼠特有的相位特征
Jose Luis Hernandez-Caceres、Mayrim Vega-Hernandez、Jorge Iglesias Fuster、Anna Dorohova、Ivan Padron-Diaz
bioRxiv
2026.10.30.762874；
doi：https://doi.org/10.64898/2026.10.30.762874
分享本文：
复制
引文工具
cGAS 的谐振识别模型分析：保守的谱频率与裸鼹鼠特有的相位特征
Jose Luis Hernandez-Caceres、Mayrim Vega-Hernandez、Jorge Iglesias Fuster、Anna Dorohova、Ivan Padron-Diaz
bioRxiv
2026.10.30.762874；
doi：https://doi.org/10.64898/2026.10.30.762874
引文管理器格式
BibTeX
Bookends
EasyBib
EndNote（tagged）
EndNote 8（xml）
Medlars
Mendeley
Papers
RefWorks Tagged
Ref Manager
RIS
Zotero
推文组件
Facebook 点赞
Google Plus +1
学科领域
生物信息学
学科领域
所有文章
动物行为与认知（8164）
生物化学（19027）
生物工程（15171）
生物信息学（45635）
生物物理学（22958）
癌症生物学（20220）
细胞生物学（27452）
临床试验（138）
发育生物学（14204）
生态学（21495）
流行病学（2067）
进化生物学（25892）
遗传学（16412）
基因组学（23929）
免疫学（19131）
微生物学（43392）
分子生物学（18442）
神经科学
(95637)
古生物学
(716)
病理学
(3054)
药理学与毒理学
(5238)
生理学
(8322)
植物生物学
(16352)
科学传播与教育
(2121)
合成生物学
(4667)
系统生物学
(10438)
动物学
(2436)
关键词：环状GMP-AMP合成酶 · 共振识别模型 · 蛋白质序列频谱分析 · 同源重组 · 裸鼹鼠 · 蛋白质相互作用预测
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.30.762874v1?rss=1