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识别并定量生物流体中的分子组分,在疾病诊断、环境污染物检测和过程监测方面具有巨大潜力。采用简单的一维¹H NMR谱完成这一任务,具有适用范围广、能够提供定量结果等优势。然而,从复杂的重叠谱图中提取单个组分,以及通过与有限的数据库条目比对来鉴定化合物,仍面临诸多困难。本文提出一种新方法,其中包括利用奇异值分解(SVD)自动分离组分谱,并将其与同时包含化学位移和标量耦合信息的数据库条目进行匹配。我们将该方法应用于粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)真菌提取物,以此展示其流程;该提取物经色谱分离后,形成二维谱图组分库。研究结果与先前的一项分析进行了比较;该分析采用半人工方式整理分离后的谱图,随后进行化学位移匹配。
摘要
生物流体中分子组分的识别与定量,在疾病诊断、环境污染物检测和过程监测方面具有巨大潜力。采用简单的一维氢-1核磁共振(¹H NMR)谱完成这一任务,具有适用范围广、能够实现定量分析等优势。然而,从复杂的重叠谱图中提取各个组分,以及通过与有限的数据库条目比对来鉴定化合物,仍面临诸多困难。本文提出一种新方案:利用奇异值分解(SVD)自动分离各组分的谱图,并将其与同时包含化学位移和标量耦合信息的数据库条目进行匹配。我们以粗糙脉孢菌(*Neurospora crassa*)的真菌提取物为例展示该方案的应用:提取物经色谱分级,构建成二维谱图组分库。研究结果与先前采用半人工方式整理分离谱图、再依据化学位移进行匹配的分析结果进行了比较。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://usnan.org/ark:/83454/c185a05632-633d-40c3-b39f-3b198a9ddd21
https://github.com/edisonomics/Metabolite_Fraction_Library_SVD
已声明的资助信息
美国国家科学基金会,
https://ror.org/021nxhr62,EEC-1648035
美国国立卫生研究院,R35 GM145348
佐治亚理工学院与佐治亚研究联盟试点资助
版权
本预印本的版权归作者/资助方所有,其已授予 bioRxiv 永久展示本预印本的许可。本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 11 月 03 日。
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《用于 NMR 馏分文库自动分析的奇异值分解》
Christopher
Esselman
,
Arthur S
Edison
,
James H
Prestegard
bioRxiv
2026.10.30.763183;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.10.30.763183
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《用于 NMR 馏分文库自动分析的奇异值分解》
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,
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2026.10.30.763183;
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https://doi.org/10.64898/2026.10.30.763183
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关键词:奇异值分解 · 氢核磁共振 · 谱图解卷积 · 代谢物鉴定 · 馏分库自动分析
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.30.763183v1?rss=1