- 2 次围观
背景:营养不良会增加结核病(TB)风险,但潜伏性结核感染(LTBI)期间的严重营养不良是否会导致类似活动性结核病的血液转录变化,或能否识别未来发生结核病的个体,目前尚不明确。方法:我们重新分析了 GSE152218 中 LTBI 成人的全血 RNA 测序数据,比较严重营养不良者(BMI <16 kg/m²;n=16)与营养充足者(BMI ≥18.5 kg/m²;n=11)。我们评估了基因和 Reactome 通路,并将七模块综合评分与严重营养不良成人活动性结核病的相关特征进行比较;在评估通路代表性后,于 GSE79362 和 GC6-74/GSE94438 中开展前瞻性检验。结果:主要模型中没有基因达到 FDR <0.05;敏感性分析中仅有两个基因达到该标准。相比之下,241 条 Reactome 通路在两个模型中均显著且变化方向一致(NES 的 Spearman 相关系数 rho=0.954),涉及补体/Fc 受体、B 细胞、磷脂/吞噬作用、中性粒细胞、血管、自噬及细胞因子信号通路。大多数通路的变化方向与活动性结核病比较结果相反(241 条中有 178 条;通路层面的 rho=-0.390)。在 GSE79362 中,七模块评分与基线时的疾病进展无关(每增加 1 个标准差对应的调整后 OR=1.090;P=0.6922)。在 GC6 中,四个模块符合预设的代表性标准;其基线评分与疾病进展呈负相关(每增加 1 个标准差对应的调整后 OR=0.711;P=0.0218),但次要分析和纵向分析未能证实这一结果。结论:LTBI 期间的严重营养不良与可重复出现的免疫及代谢相关转录重塑有关,其特征不同于活动性结核病的生物学特征,且不能稳定地识别未来会进展为结核病的个体。
潜伏性结核感染期间重度营养不良患者的免疫与代谢通路呈现不同的转录重塑,但无法在独立队列中持续预测结核病进展 | bioRxiv
跳转至主要内容
首页
关于
投稿
提醒 / RSS
搜索关键词
高级搜索
最新结果
潜伏性结核感染期间重度营养不良患者的免疫与代谢通路呈现不同的转录重塑,但无法在独立队列中持续预测结核病进展
查看 ORCID 个人资料
Reuben S. Maghembe,
查看 ORCID 个人资料
Vesla I. Kullaya,
查看 ORCID 个人资料
Peter M. Mbelele,
查看 ORCID 个人资料
Ritah Francis Mutagonda,
查看 ORCID 个人资料
Samweli Bahati,
查看 ORCID 个人资料
Kennedy M. Ngowi,
查看 ORCID 个人资料
Lydia Nakiyingi,
查看 ORCID 个人资料
Megan Null,
查看 ORCID 个人资料
Jon M. Jacobs,
查看 ORCID 个人资料
William Evan Johnson,
查看 ORCID 个人资料
Pranay Sinha,
查看 ORCID 个人资料
Scott K. Heysell,
查看 ORCID 个人资料
Stellah George Mpagama,
查看 ORCID 个人资料
Sana Syed
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.10.26.756475
Reuben S. Maghembe
1
坦桑尼亚伊法卡拉,圣弗朗西斯健康与相关科学大学学院(SFUCHAS)医学院微生物学与寄生虫学系;坦桑尼亚乞力马扎罗,Kibong'oto传染病医院(KIDH);医学系,Div;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本站搜索该作者
Reuben S. Maghembe 的 ORCID 记录
联系事宜:
rmaghembe{at}gmail.com
Vesla I. Kullaya
2
坦桑尼亚乞力马扎罗,乞力马扎罗临床研究所(KCRI)、乞力马扎罗基督教医疗中心(KCMC);坦桑尼亚莫希,KCMC大学医学生物化学与分子生物学系;
查找该……
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Vesla I. Kullaya 的 ORCID 记录
Peter M. Mbelele
3
坦桑尼亚乞力马扎罗地区,乞力马扎罗传染病医院(KIDH);坦桑尼亚达累斯萨拉姆,穆欣比利健康与联合健康科学大学(MUHAS)微生物学与免疫学系;
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Peter M. Mbelele 的 ORCID 记录
Ritah Francis Mutagonda
4
坦桑尼亚达累斯萨拉姆,穆欣比利健康与联合健康科学大学(MUHAS)药学院临床药学与药理学系;
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Ritah Francis Mutagonda 的 ORCID 记录
Samweli Bahati
5
坦桑尼亚达累斯萨拉姆,Kivukoni,Bridge Street,AfroBiomics Co. Ltd. 组学与计算生物学系;
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Samweli Bahati 的 ORCID 记录
Kennedy M. Ngowi
6
坦桑尼亚莫希,乞力马扎罗基督教医疗中心(KCMC)乞力马扎罗临床研究所(KCRI);
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Kennedy M. Ngowi 的 ORCID 记录
Lydia Nakiyingi
7
乌干达坎帕拉,马凯雷雷大学健康科学学院医学院内科系;乌干达坎帕拉,马凯雷雷大学健康科学学院马凯雷雷大学生物医学研究中心;传染病研究所,Ma;
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Lydia Nakiyingi 的 ORCID 记录
Megan Null
8
内科系,传染病学部,以及
国际卫生部,弗吉尼亚大学医学院,美国弗吉尼亚州夏洛茨维尔;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站上搜索该作者
Megan Null 的 ORCID 记录
Jon M. Jacobs
9
环境分子科学部,太平洋西北国家实验室,美国华盛顿州里奇兰;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站上搜索该作者
Jon M. Jacobs 的 ORCID 记录
William Evan Johnson
10
计算生物医学科,医学系,波士顿大学乔巴尼安与阿维迪西安医学院,美国马萨诸塞州波士顿;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站上搜索该作者
William Evan Johnson 的 ORCID 记录
Pranay Sinha
11
传染病科,医学系,波士顿大学乔巴尼安与阿维迪西安医学院,美国马萨诸塞州波士顿;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站上搜索该作者
Pranay Sinha 的 ORCID 记录
Scott K. Heysell
8
医学系传染病与国际卫生部,弗吉尼亚大学医学院,美国弗吉尼亚州夏洛茨维尔;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站上搜索该作者
Scott K. Heysell 的 ORCID 记录
Stellah George Mpagama
12
基翁博托传染病医院(KIDH),坦桑尼亚乞力马扎罗;
在 Google Scholar 上查找该作者
在 PubMed 上查找该作者
在本网站上搜索该作者
Stellah George Mpagama 的 ORCID 记录
Sana Syed
13
儿科系,杜克大学医学院,美国北卡罗来纳州达勒姆;杜克大学杜克临床研究所,美国北卡罗来纳州达勒姆,
美国
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本网站搜索此作者
Sana Syed 的 ORCID 记录
摘要
信息/历史
指标
补充材料
数据/代码
PDF 预览
摘要
背景:营养不良会增加结核病(TB)风险,但潜伏性结核感染(LTBI)期间的严重营养不良是否会引发类似活动性结核病的血液转录变化,或能否识别未来发生结核病的风险,目前尚不明确。
方法:我们重新分析了 GSE152218 中 LTBI 成人的全血 RNA 测序数据,比较严重营养不良者(BMI <16 kg/m²;n=16)与营养充足者(BMI ≥18.5 kg/m²;n=11)。我们评估了基因和 Reactome 通路,并将一个由七个模块构成的汇总指标与严重营养不良成人活动性结核病患者的数据进行比较;在评估通路代表性后,又在 GSE79362 和 GC6-74/GSE94438 中对其进行了前瞻性检验。
结果:在主要模型中,没有基因达到 FDR <0.05;仅在敏感性分析中有两个基因达到该阈值。相比之下,241 条 Reactome 通路在两个模型中均达到显著性,且方向一致(NES ρ=0.954),包括补体/Fc 受体、B 细胞、磷脂/吞噬作用、中性粒细胞、血管、自噬及细胞因子信号通路。大多数通路的变化方向与活动性结核病比较结果相反(241 条中有 178 条;通路 ρ=-0.390)。在 GSE79362 中,七模块评分与基线时的疾病进展无关(每 SD 校正 OR=1.090;P=0.6922)。在 GC6 中,四个模块达到预先设定的代表性标准;其基线评分与疾病进展呈负相关(每 SD 校正 OR=0.711;P=0.0218),但次要分析和纵向分析未能确认这一结果。
结论:LTBI 期间的严重营养不良与可重复的免疫及代谢相关转录重塑有关,该变化不同于 在天天中彩票
活动性结核病(active TB)的生物学特征,且不能始终一致地识别未来的结核病进展。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://zenodo.org/records/22685970
已声明的资助者信息
Fogarty国际中心,
,D43 TW012247
版权
本预印本的版权所有者为作者/资助者,其已授予 bioRxiv 一项永久展示该预印本的许可。
该预印本依据
CC-BY 4.0 国际许可
公开发布。
返回顶部
上一篇
发布于2026年10月28日。
下载PDF
补充材料
数据/代码
电子邮件
感谢您有兴趣传播 bioRxiv 上的这篇文章。
注意:系统要求提供您的电子邮件地址,仅用于确认您是该文章的发送者。
您的电子邮件地址
*
您的姓名
*
发送至
*
请在不同地址之间换行,或使用逗号分隔多个地址。
您将向以下对象发送电子邮件
潜伏性结核感染期间重度营养不良导致免疫和代谢通路发生 distinct 的转录重塑,但在不同独立队列中不能始终预测结核病进展
邮件主题:(您的姓名)已将 bioRxiv 上的一个页面转发给您
邮件正文:(您的姓名)认为您可能会对 bioRxiv 网站上的这一页面感兴趣。
您的个人留言:
验证码
此问题用于测试您是否为真实访客,并防止自动发送垃圾邮件。
分享
潜伏性结核感染期间重度营养不良导致免疫和代谢通路发生 distinct 的转录重塑,但在不同独立队列中不能始终预测结核病进展
Reuben S. Maghembe,
Vesla I. Kullaya,
Peter M. Mbelele,
Ritah Francis Mutagonda,
Samweli Bahati,
Kennedy M. Ngowi,
Lydia Nakiyingi,
Megan Null,
Jon M.
雅各布斯
、威廉·埃文
约翰逊
、普拉奈
辛哈
、斯科特·K.
海塞尔
、斯特拉·乔治
姆帕加马
、萨娜
赛义德
bioRxiv
2026.10.26.756475;
doi:https://doi.org/10.64898/2026.10.26.756475
分享本文:
复制
引用工具
潜伏性结核感染期间重度营养不良引发免疫与代谢通路的差异性转录重塑,但无法在不同独立队列中稳定预测结核病进展
鲁本·S.
马盖姆贝
、维斯拉·I.
库拉亚
、彼得·M.
姆贝莱莱
、丽塔·弗朗西斯
穆塔贡达
、萨姆韦利
巴哈蒂
、肯尼迪·M.
恩戈维
、莉迪亚
纳基因吉
、梅根
纳尔
、乔恩·M.
雅各布斯
、威廉·埃文
约翰逊
、普拉奈
辛哈
、斯科特·K.
海塞尔
、斯特拉·乔治
姆帕加马
、萨娜
赛义德
bioRxiv
2026.10.26.756475;
doi:https://doi.org/10.64898/2026.10.26.756475
引文管理器格式
BibTeX
Bookends
EasyBib
EndNote(tagged)
EndNote 8(xml)
Medlars
Mendeley
Papers
RefWorks Tagged
Ref Manager
RIS
Zotero
推文组件
Facebook 点赞
Google +1
学科领域
分子生物学
学科分类
所有文章
动物行为与认知(8164)
生物化学(19027)
生物工程(15171)
生物信息学(45462)
生物物理学(22958)
癌症生物学(20161)
细胞生物学(27357)
临床试验(138)
发育生物学(14173)
生态学(21435)
流行病学(2067)
进化生物学(25848)
遗传学(16374)
基因组学(23871)
免疫学(19069)
微生物学(43263)
分子生物学(18390)
神经科学(95312)
古生物学(715)
病理学(3039)
药理学与毒理学(5215)
生理学(8295)
植物生物学(16300)
科学传播与教育(2118)
合成生物学(4653)
系统生物学(10412)
动物学(2428)
关键词:潜伏性结核感染 · 严重营养不良 · 转录组分析 · 免疫与代谢通路 · 结核病进展预测
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.26.756475v1?rss=1