潜伏性结核感染期间严重营养不良引发免疫与代谢通路的差异性转录重塑,但其无法在不同独立队列中稳定预测结核病进展

由 root 提交于 周六, 10/31/2026 - 00:47
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背景:营养不良会增加结核病(TB)风险,但潜伏性结核感染(LTBI)期间的严重营养不良是否会导致类似活动性结核病的血液转录变化,或能否识别未来发生结核病的个体,目前尚不明确。方法:我们重新分析了 GSE152218 中 LTBI 成人的全血 RNA 测序数据,比较严重营养不良者(BMI <16 kg/m²;n=16)与营养充足者(BMI ≥18.5 kg/m²;n=11)。我们评估了基因和 Reactome 通路,并将七模块综合评分与严重营养不良成人活动性结核病的相关特征进行比较;在评估通路代表性后,于 GSE79362 和 GC6-74/GSE94438 中开展前瞻性检验。结果:主要模型中没有基因达到 FDR <0.05;敏感性分析中仅有两个基因达到该标准。相比之下,241 条 Reactome 通路在两个模型中均显著且变化方向一致(NES 的 Spearman 相关系数 rho=0.954),涉及补体/Fc 受体、B 细胞、磷脂/吞噬作用、中性粒细胞、血管、自噬及细胞因子信号通路。大多数通路的变化方向与活动性结核病比较结果相反(241 条中有 178 条;通路层面的 rho=-0.390)。在 GSE79362 中,七模块评分与基线时的疾病进展无关(每增加 1 个标准差对应的调整后 OR=1.090;P=0.6922)。在 GC6 中,四个模块符合预设的代表性标准;其基线评分与疾病进展呈负相关(每增加 1 个标准差对应的调整后 OR=0.711;P=0.0218),但次要分析和纵向分析未能证实这一结果。结论:LTBI 期间的严重营养不良与可重复出现的免疫及代谢相关转录重塑有关,其特征不同于活动性结核病的生物学特征,且不能稳定地识别未来会进展为结核病的个体。

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Sana Syed

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.10.26.756475

Reuben S. Maghembe

1

坦桑尼亚伊法卡拉,圣弗朗西斯健康与相关科学大学学院(SFUCHAS)医学院微生物学与寄生虫学系;坦桑尼亚乞力马扎罗,Kibong'oto传染病医院(KIDH);医学系,Div;

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Vesla I. Kullaya

2

坦桑尼亚乞力马扎罗,乞力马扎罗临床研究所(KCRI)、乞力马扎罗基督教医疗中心(KCMC);坦桑尼亚莫希,KCMC大学医学生物化学与分子生物学系;

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Peter M. Mbelele

3

坦桑尼亚乞力马扎罗地区,乞力马扎罗传染病医院(KIDH);坦桑尼亚达累斯萨拉姆,穆欣比利健康与联合健康科学大学(MUHAS)微生物学与免疫学系;

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Ritah Francis Mutagonda

4

坦桑尼亚达累斯萨拉姆,穆欣比利健康与联合健康科学大学(MUHAS)药学院临床药学与药理学系;

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Samweli Bahati

5

坦桑尼亚达累斯萨拉姆,Kivukoni,Bridge Street,AfroBiomics Co. Ltd. 组学与计算生物学系;

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Kennedy M. Ngowi

6

坦桑尼亚莫希,乞力马扎罗基督教医疗中心(KCMC)乞力马扎罗临床研究所(KCRI);

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Lydia Nakiyingi

7

乌干达坎帕拉,马凯雷雷大学健康科学学院医学院内科系;乌干达坎帕拉,马凯雷雷大学健康科学学院马凯雷雷大学生物医学研究中心;传染病研究所,Ma;

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Megan Null

8

内科系,传染病学部,以及

国际卫生部,弗吉尼亚大学医学院,美国弗吉尼亚州夏洛茨维尔;

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Jon M. Jacobs

9

环境分子科学部,太平洋西北国家实验室,美国华盛顿州里奇兰;

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William Evan Johnson

10

计算生物医学科,医学系,波士顿大学乔巴尼安与阿维迪西安医学院,美国马萨诸塞州波士顿;

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Pranay Sinha

11

传染病科,医学系,波士顿大学乔巴尼安与阿维迪西安医学院,美国马萨诸塞州波士顿;

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Scott K. Heysell

8

医学系传染病与国际卫生部,弗吉尼亚大学医学院,美国弗吉尼亚州夏洛茨维尔;

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Stellah George Mpagama

12

基翁博托传染病医院(KIDH),坦桑尼亚乞力马扎罗;

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Sana Syed

13

儿科系,杜克大学医学院,美国北卡罗来纳州达勒姆;杜克大学杜克临床研究所,美国北卡罗来纳州达勒姆,

美国

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背景:营养不良会增加结核病(TB)风险,但潜伏性结核感染(LTBI)期间的严重营养不良是否会引发类似活动性结核病的血液转录变化,或能否识别未来发生结核病的风险,目前尚不明确。

方法:我们重新分析了 GSE152218 中 LTBI 成人的全血 RNA 测序数据,比较严重营养不良者(BMI <16 kg/m²;n=16)与营养充足者(BMI ≥18.5 kg/m²;n=11)。我们评估了基因和 Reactome 通路,并将一个由七个模块构成的汇总指标与严重营养不良成人活动性结核病患者的数据进行比较;在评估通路代表性后,又在 GSE79362 和 GC6-74/GSE94438 中对其进行了前瞻性检验。

结果:在主要模型中,没有基因达到 FDR <0.05;仅在敏感性分析中有两个基因达到该阈值。相比之下,241 条 Reactome 通路在两个模型中均达到显著性,且方向一致(NES ρ=0.954),包括补体/Fc 受体、B 细胞、磷脂/吞噬作用、中性粒细胞、血管、自噬及细胞因子信号通路。大多数通路的变化方向与活动性结核病比较结果相反(241 条中有 178 条;通路 ρ=-0.390)。在 GSE79362 中,七模块评分与基线时的疾病进展无关(每 SD 校正 OR=1.090;P=0.6922)。在 GC6 中,四个模块达到预先设定的代表性标准;其基线评分与疾病进展呈负相关(每 SD 校正 OR=0.711;P=0.0218),但次要分析和纵向分析未能确认这一结果。

结论:LTBI 期间的严重营养不良与可重复的免疫及代谢相关转录重塑有关,该变化不同于 在天天中彩票

活动性结核病(active TB)的生物学特征,且不能始终一致地识别未来的结核病进展。

利益冲突声明

作者声明不存在利益冲突。

脚注

https://zenodo.org/records/22685970

已声明的资助者信息

Fogarty国际中心,

https://ror.org/02xey9a22

,D43 TW012247

版权

本预印本的版权所有者为作者/资助者,其已授予 bioRxiv 一项永久展示该预印本的许可。

该预印本依据

CC-BY 4.0 国际许可

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关键词:潜伏性结核感染 · 严重营养不良 · 转录组分析 · 免疫与代谢通路 · 结核病进展预测

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.26.756475v1?rss=1