法国地方马品种遗传多样性的历史与当代管理:基因组数据带来的启示

由 root 提交于 周四, 10/29/2026 - 04:47
摘要

当今全球马匹的表型和遗传多样性,可能源于两个主要事件:(i)驯化;(ii)此后的品种培育。尽管许多研究探讨了马的起源与驯化,但鲜有研究关注第二个重要事件,而这一事件在很大程度上塑造了马匹当前的遗传结构。本研究全面考察了法国全部18个地方马品种。这些品种均因种群规模较小而濒临灭绝,容易受到遗传漂变、遗传多样性丧失及近交衰退的影响。虽然已有系谱记录,但往往不完整或存在错误。因此,我们利用分子标记重建法国地方马品种的历史,并监测遗传多样性的变化及其与管理实践的关联。本研究以976匹马为对象(每个品种约50匹),样本涵盖两个时期,分别对应管理方式从公立种马场转向私有化的阶段。研究采用专用于遗传资源特征分析的1万位点SNP芯片对样本进行基因分型。法国地方马不仅在表型上可分为两类,在遗传上亦然:体型较轻的“地方型”品种和体型较重的“挽马型”品种。两类之间存在持续的基因流动,这与历史记录相吻合。两个时期内亲缘关系和近交水平的变化,在不同样本群及各品种间呈现出不同模式,反映了不同管理实践所造成的多种影响。总之,本研究首次全面描绘了法国地方马的演变过程,同时证明了基因组数据在监测遗传多样性和评估管理项目成效方面的价值。

当今世界各地马匹的表型和遗传多样性可能源于两个主要事件:(i)驯化;以及其后的(ii)品种培育。尽管许多研究探讨了马的起源与驯化,但很少有研究关注第二个重要事件,而该事件在很大程度上塑造了当前马匹的遗传结构。本研究全面考察了法国全部18个地方马品种;由于这些品种的种群规模较小,均面临濒危风险,因而易受到遗传漂变、多样性丧失和近交衰退的影响。尽管已有系谱资料,但这些资料往往不完整或存在错误。因此,我们利用分子标记重建法国地方马品种的历史,并监测遗传多样性的演变及其与管理实践之间的联系。本研究基于976匹马(每个品种约50匹),涵盖两个时期,分别对应于管理模式从公共种马场向私有化转变的阶段。采用专门用于遗传资源特征分析的1万位点SNP芯片对样本进行基因分型。法国地方马不仅可以根据表型进行分类,也可以根据遗传特征分为两类:体型较轻的“地域型”品种和体型较重的“挽马型”品种;观察到两类之间存在规律性的基因流,这与历史记录相吻合。两个时期内亲缘关系和近交水平的变化,在不同群体之间及各品种之间呈现出明显不同的模式,反映了不同管理实践所产生的多种后果。总之,本研究首次全面描绘了法国地方马的演变过程,同时也证明了基因组数据在监测遗传多样性和评估管理方案有效性方面的实用价值。

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关键词:法国地方马 · 遗传多样性 · 群体遗传结构 · 基因流动 · 近交水平 · 遗传资源管理

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.21.760631v1?rss=1