两种新热带疟疾媒介按蚊(Anopheles cruzii 和 Anopheles aquasalis)的 Y 染色体基因贫乏、重复序列丰富特征

由 root 提交于 周三, 10/28/2026 - 02:47

内容形式:摘要译文

Y 染色体难以测序和组装;在按蚊属中,其特征研究主要集中于亚属 Cellia。本研究通过比较雌雄个体的数据,并采用 Y 染色体基因组扫描(YGS)和染色体商数(CQ)方法,鉴定出来自其他亚属的两种新热带疟疾媒介——An. (Kerteszia) cruzii 和 An. (Nyssorhynchus) aquasalis——中的 Y 连锁序列。在 An. cruzii C 谱系中,15 条长读长重叠群(2.53 Mb,占雄性组装序列的 1.4%)同时满足两项判定标准;在 An. aquasalis 中,符合标准的有 267 条短读长重叠群(201.7 kb)。An. cruzii 的候选 Y 序列中重复序列占 88.6%,而基因组其余部分中仅占 13.9%;这一比例升高主要由 LINE 和 LTR 反转座子驱动。Gypsy 和 BEL/Pao 元件在 An. aquasalis 中也呈富集。一种年轻的 BEL/Pao 亚家族包含 5 个近乎相同且开放阅读框完整的拷贝,均位于 An. cruzii 的 Y 染色体上;该亚家族主要通过较大片段的重复扩增而增殖。两条 Y 染色体上均未检测到完整的宿主蛋白质编码基因。An. cruzii 的 Y 染色体携带来自多个染色体臂的 17 个基因的退化片段,其中一些以多基因片段的形式获得后又发生扩增;这些片段大多也存在于隐蔽谱系 A 中。An. aquasalis 的 Y 染色体则携带 tsunagi 基因的一个片段。基于低拷贝雄性特异区域设计的 12 对引物中,有 11 对仅在雄性 DNA 中扩增出预期产物。这些结果表明,富含重复序列、基因贫乏的模式不仅存在于冈比亚按蚊复合种的 Y 染色体中,也见于两个新热带谱系,并为这两种媒介按蚊提供了候选雄性特异性标记。

关键词:按蚊 · Y染色体 · 重复序列 · 反转座子 · 疟疾媒介

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.23.761439v1?rss=1