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内容形式:摘要译文
在果蝇卵巢中,发育中的卵母细胞分泌一种局部诱导信号——Gurken(Grk),该信号可激活覆盖其上的滤泡上皮中的果蝇表皮生长因子受体(EGFR)。Grk 的定位具有动态变化,而 Grk/EGFR 信号会因信号发生的时间和位置不同而产生不同结果。在早期阶段,Grk 定位于后端,并诱导后部命运,其特征是表达 T-box 转录因子 midline(mid)和 H15。随后,Grk 转而定位于背侧前端,并诱导背侧前端命运决定因子 mirror(mirr)的表达;mirr 编码一种同源结构域转录因子。Grk/EGFR 信号依赖情境而产生的这些结果彼此互斥,由此引出一个问题:靶基因表达的选择是如何调控的?我们此前已证明,这些不同的信号结果由局部化的、方向相反的后部 JAK/STAT 通路与前部 BMP 通路活性梯度,以及 Mid/H15 与 Mirr 之间的相互抑制所决定。这些调控相互作用构成一个遗传网络,该网络作为双稳态开关,在不同的 EGFR 信号结果之间切换。我们推测,这些空间信息最终由与 mid、H15 和 mirr 基因座相关的调控元件加以解读;然而,目前尚不清楚这些多重线索是在何种层面上整合,从而产生上述结果。为探究这一问题,我们筛查了两套全基因组转录报告基因资源,寻找包含 H15、mid 和 mirr 基因座基因组区域、且表达模式与内源基因相似的报告基因。在此,我们对其中四个推定的顺式调控区域的表达进行了表征,其中两个来自 mid 基因座,另外两个来自 mirr 基因座,并对它们的……
对该模式化网络中已知上游调控因子的响应。我们发现,每个序列均再现了内源基因表达及其响应的不同方面,同时还呈现出一些新出现的特征,表明这些区域并非严格以模块化方式发挥功能。这些数据鉴定出了能够驱动该组织中模式化表达的基因组序列,并为探究这些序列是否受到该模式化网络中上游空间线索直接调控提供了一个简化系统。
关键词:顺式调控元件 · 果蝇卵泡细胞 · 细胞命运决定 · EGFR信号通路 · 基因表达调控
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.22.760784v1?rss=1