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儿童急性髓系白血病（pAML）仍是导致儿童癌症死亡的主要疾病之一，其异质性是有效免疫治疗面临的一大障碍。为制定能够充分考虑这种异质性的合理免疫治疗方案，我们整合了单细胞转录组学与表面蛋白质组学（CITE-seq）。通过采用整合框架识别恶性细胞并无偏识别基因程序，我们鉴定出三种保守的白血病干细胞（LSC）亚型：原始型（P-LSC）、单核细胞型（M-LSC）和类红系型（E-LSC）。这些亚型常以不同比例共存于同一患者体内，代表具有特征性免疫表型和转录程序的不同干细胞状态。对表面抗原进行定量分析显示，没有任何单一靶点能够覆盖全部 LSC。CLEC12A 是目前正在临床评估的抗原，在 P-LSC 和 M-LSC 中均有表达，但在 E-LSC 中大多缺失。相比之下，CD84 在 P-LSC 和 M-LSC 群体中提供了互补覆盖，并且是 E-LSC 群体中的主要靶点。CLEC12A 与 CD84 联合使用可广泛覆盖全部三种 LSC 亚型，同时避免靶向健康造血干细胞。在独立的单细胞和整体样本队列中进行的验证证实了这一组合的稳健性。这些发现建立了一个用于 AML 抗原优先级排序的儿童特异性框架，确定 CLEC12A/CD84 是一种能够覆盖异质性 LSC 状态的稳健双靶向策略，并为合理设计下一代 CAR T 细胞联合疗法提供了蓝图。
复发性白血病干细胞状态界定儿童急性髓系白血病的抗原图谱 | bioRxiv
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复发性白血病干细胞状态界定儿童急性髓系白血病的抗原图谱
Sina Kanannejad、Macarena Oporto Espuelas、Claudia D'Oria、Filippo Martignano、Ilaria Marina Michelozzi、Soumick Chatterjee、Edoardo Giacopuzzi、Eduardo Gomez Castaneda、Aurora Casiraghi、Theodoros Xenakis、George T. Hall、Efstratios Kirtsios、Cecilia Reyneri、Hannah Macpherson、Jack Bartram、Rebecca Thomas、Sergi Castellano、Persis J. Amrolia、Alice Giustacchini（查看 ORCID 个人资料）
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.19.760044
Sina Kanannejad
1
人类技术研究所基因组学研究中心，意大利米兰；
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Macarena Oporto Espuelas
2
伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所感染、免疫与炎症学部，英国伦敦；
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Claudia D'Oria
1
人类技术研究所基因组学研究中心，意大利米兰；
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Filippo Martignano
1
人类技术研究所基因组学研究中心，意大利米兰；
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Ilaria Marina Michelozzi
2
伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所感染、免疫与炎症学部，英国伦敦；
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Soumick Chatterjee
3
意大利米兰 Human Technopole 基因组学研究中心；德国马格德堡奥托·冯·居里克大学计算机科学学院；
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Edoardo Giacopuzzi
1
意大利米兰 Human Technopole 基因组学研究中心；
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Eduardo Gomez Castaneda
2
英国伦敦，伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所感染、免疫与炎症学部；
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Aurora Casiraghi
1
意大利米兰 Human Technopole 基因组学研究中心；
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Theodoros Xenakis
4
英国伦敦，伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所遗传学与基因组医学学部；
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George T. Hall
4
英国伦敦，伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所遗传学与基因组医学学部；
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Efstratios Kirtsios
2
英国伦敦，伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所感染、免疫与炎症学部；
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Cecilia Reyneri
1
意大利米兰 Human Technopole 基因组学研究中心；
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Hannah Macpherson
4
英国伦敦，伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所遗传学与基因组医学学部；
英国；
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Jack Bartram
5
英国伦敦大奥蒙德街儿童医院；英国伦敦北泰晤士基因组实验室中心；
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Rebecca Thomas
6
英国伦敦大奥蒙德街医院血液科；
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Sergi Castellano
4
英国伦敦伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所遗传学与基因组医学系；
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Persis J. Amrolia
7
英国伦敦伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所感染、免疫与炎症系；英国伦敦大奥蒙德街医院骨髓移植科；
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Alice Giustacchini
8
意大利米兰人类技术研究所基因组学研究中心；英国伦敦伦敦大学学院大奥蒙德街儿童健康研究所感染、免疫与炎症系
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a.giustacchini{at}ucl.ac.uk
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摘要
儿童急性髓系白血病（pAML）仍是导致儿童癌症死亡的主要原因之一，而疾病异质性是有效免疫治疗面临的一大障碍。为实现能够兼顾这种异质性的合理免疫治疗设计，
我们结合了单细胞转录组学与表面蛋白质组学（CITE-seq）。通过采用整合性的恶性细胞识别与无偏基因程序识别框架，我们解析出三种具有保守性的白血病干细胞（LSC）亚型：原始型（P-LSC）、单核细胞型（M-LSC）和类红系型（E-LSC）。这三种亚型常以不同比例共存于同一患者体内，代表具有特征性免疫表型和转录程序的不同干细胞状态。定量表面抗原谱分析显示，没有任何单一靶点能够覆盖全部LSC。CLEC12A是一种目前正在接受临床评估的抗原，在P-LSC和M-LSC中均有表达，但在E-LSC中基本缺失。相比之下，CD84在P组和M组中提供了互补性覆盖，并在E-LSC群体中作为主要靶点。CLEC12A与CD84联用可广泛覆盖全部三种LSC亚型，同时避免作用于健康造血干细胞。在独立的单细胞队列和批量测序队列中进行的验证证实了这一组合的稳健性。这些发现建立了一个针对儿童AML的抗原优先级排序框架，确定CLEC12A/CD84是一种可覆盖异质性LSC状态的稳健双靶向策略，并为理性设计下一代CAR T细胞联合疗法提供了蓝图。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
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版权所有者为本预印本的作者/资助方，其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。
保留所有权利。未经许可不得重复使用。
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发布于2026年10月23日。
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《复发性白血病干细胞状态界定儿童急性髓系白血病》
Sina Kanannejad、Macarena Oporto Espuelas、Claudia D'Oria、Filippo Martignano、Ilaria Marina Michelozzi、Soumick Chatterjee、Edoardo Giacopuzzi、Eduardo Gomez Castaneda、Aurora Casiraghi、Theodoros Xenakis、George T. Hall、Efstratios Kirtsios、Cecilia Reyneri、Hannah Macpherson、Jack Bartram、Rebecca Thomas、Sergi Castellano、Persis J. Amrolia、Alice Giustacchini
bioRxiv
2026.10.19.760044；
doi：https://doi.org/10.64898/2026.10.19.760044
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《复发性白血病干细胞状态界定儿童急性髓系白血病的抗原景观》
Sina Kanannejad、Macarena Oporto Espuelas、Claudia D'Oria、Filippo Martignano、Ilaria Marina Michelozzi、Soumick Chatterjee、Edoardo Giacopuzzi、Eduardo Gomez Castaneda、Aurora Casiraghi、Theodoros Xenakis、George T. Hall、Efstratios Kirtsios、Cecilia Reyneri、Hannah Macpherson、Jack Bartram、Rebecca Thomas、Sergi Castellano、Persis J. Amrolia、Alice Giustacchini
bioRxiv
2026.10.19.760044；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.19.760044
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关键词：儿童急性髓系白血病 · 白血病干细胞 · 单细胞转录组学 · 表面蛋白质组学 · CLEC12A/CD84双靶向 · CAR-T细胞疗法
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.19.760044v1?rss=1