- 2 次围观
珊瑚与多样的微生物群落形成复杂的共生关系，这些微生物群落会影响珊瑚的生理、进化及生态功能。在基于 16S rRNA 基因的微生物组分析中，分类上归为叶绿体的序列往往被视为噪声而丢弃，然而这些序列蕴含着宝贵的生态信息。本文对公开可用的 16S rRNA 基因数据集进行了荟萃分析，考察珊瑚中含质体微型真核生物共生体的多样性及其全球分布。我们重新处理了来自 45 项研究的 2,679 个样本，构建了一个包含 10,950 个扩增子序列变体（ASV）的数据集；这些变体来自 1,300 万对测序读段，覆盖 73 种珊瑚、23 个科、所有主要海洋区域，以及三种宿主健康状态。珊瑚虫球菌类（Corallicolida）和绿藻属（Ostreobium）在所有珊瑚谱系、健康状态及地点中均具有很高的丰度，证实它们是除甲藻科（Symbiodiniaceae）之外分布最广泛的含质体珊瑚共生体。丰度最高的 ASV 表现出显著的宿主特异性：大多数序列仅限于特定珊瑚谱系，这一模式与系统发育共生现象相符，且得到全数据集 ASV 水平群落特征的支持。对顶复门序列的系统发育定位显示，其中大多数可归为珊瑚虫球菌类，并揭示出一组与新型顶复门相关谱系相符的 ASV，我们暂将其命名为 ARL-XXI。研究共鉴定出六个不同的绿藻属支系，其中三个为本文首次描述；西北太平洋则显示出可能是绿藻属多样性热点的特征。总体而言，这些结果凸显了保留质体来源序列的价值，并强调在分子调查中纳入微型真核生物，对于理解珊瑚全生物体的生态动态至关重要。
珊瑚全共生体中含质体微型真核生物的全球分布与宿主特异性 | bioRxiv
跳至主要内容
首页
关于
投稿
提醒 / RSS
搜索此关键词
高级搜索
最新结果
珊瑚全共生体中含质体微型真核生物的全球分布与宿主特异性
查看 ORCID 个人资料
Joana Krause-Massaguer，
查看 ORCID 个人资料
Bradley A. Weiler，
查看 ORCID 个人资料
Javier del Campo
DOI：
https://doi.org/10.64898/2026.10.20.759601
Joana Krause-Massaguer¹
进化生物学研究所；
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Joana Krause-Massaguer 的 ORCID 记录
Bradley A. Weiler²
迈阿密大学罗森斯蒂尔海洋与大气科学学院
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Bradley A. Weiler 的 ORCID 记录
Javier del Campo¹
进化生物学研究所；
在 Google Scholar 上查找此作者
在 PubMed 上查找此作者
在本站搜索此作者
Javier del Campo 的 ORCID 记录
通讯请联系：
jdelcampo{at}ibe.upf-csic.es
摘要
信息 / 历史
指标
补充材料
PDF 预览
摘要
珊瑚与多种微生物群落形成复杂的共生关系，这些群落会影响珊瑚的生理、进化和生态功能。在基于 16S rRNA 基因的微生物组分析中，分类学上归为叶绿体的序列常被视为噪声而剔除；然而，这些序列包含有价值的生态学信息。在此，我们对公开可用的 16S rRNA 基因数据集进行荟萃分析，考察珊瑚中含质体微型真核共生体的多样性及其全球分布。我们重新处理了来自 45 项研究的 2,679 个样本，生成了一个包含 10,950 条扩增子序列……
来自涵盖 73 种珊瑚、23 个科、所有主要海洋区域及三种宿主健康状态的 1300 万对测序读段的变体（ASV）分析显示，珊瑚质体虫（Corallicolida）和绿藻虫（Ostreobium）在所有珊瑚谱系、健康状态和地点中均具有很高的丰度，证实它们是除虫黄藻科（Symbiodiniaceae）之外分布最广泛的含质体珊瑚共生生物。丰度最高的 ASV 表现出显著的宿主特异性：大多数序列仅见于特定珊瑚谱系，这一模式与系统发育共生现象相符，并得到整个数据集中 ASV 层级群落谱的支持。对顶复门读段进行系统发育定位后发现，其中大多数被归类为珊瑚质体虫；此外，还发现了一些 ASV，其特征与一个新型顶复门相关谱系相符，暂定名为 ARL-XXI。研究共鉴定出六个不同的绿藻虫分支，其中三个为本文首次描述；西北太平洋则可能是绿藻虫多样性的热点地区。总体而言，这些结果凸显了保留质体来源序列的价值，并强调将微型真核生物纳入分子调查对于理解珊瑚全生物体的生态动态至关重要。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助方信息
国家研究署（Agencia Estatal de Investigación），
https://ror.org/003x0zc53，PID2023-152522NB-I00
拉蒙·阿雷塞斯基金会（Fundación Ramón Areces），
版权
本预印本的版权归作者／资助方所有；其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
返回顶部
上一篇
下一篇
发布于 2026 年 10 月 21 日。
下载 PDF
补充材料
电子邮件
感谢您有意传播 bioRxiv 的信息。
注意：您的电子邮件地址是
仅要求将您标识为本文的发送者。
您的电子邮箱
*
您的姓名
*
发送至
*
请输入多个地址，每行一个，或用逗号分隔。
您将要发送以下内容
珊瑚全共生体中含质体微型真核生物的全球分布及宿主特异性
邮件主题
（您的姓名）从 bioRxiv 网站转发了一个页面给您
邮件正文
（您的姓名）认为您可能会想浏览 bioRxiv 网站上的这个页面。
您的个人留言
验证码
此问题用于测试您是否为真人访客，并防止自动垃圾信息提交。
分享
珊瑚全共生体中含质体微型真核生物的全球分布及宿主特异性
Joana Krause-Massaguer，
Bradley A Weiler，
Javier del Campo
bioRxiv
2026.10.20.759601；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.20.759601
分享本文：
复制
引文工具
珊瑚全共生体中含质体微型真核生物的全球分布及宿主特异性
Joana Krause-Massaguer，
Bradley A Weiler，
Javier del Campo
bioRxiv
2026.10.20.759601；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.20.759601
引文管理器格式
BibTeX
Bookends
EasyBib
EndNote（tagged）
EndNote 8（xml）
Medlars
Mendeley
Papers
RefWorks Tagged
Ref Manager
RIS
Zotero
推文小组件
Facebook 点赞
Google Plus +1
主题领域
所有文章
动物行为与认知
（8164）
动物行为与认知
（8169）
动物行为与认知
动物行为与认知
（8165）
动物行为与认知
（8165）
动物行为与认知
（8165）
动物行为与认知
（8165）
动物行为与认知
动物行为与认知
（8165）
动物行为与认知
动物行为与认知
（8165）
动物行为与认知
动物行为与认知
动物行为与认知
行为与认知
（8165）
生物化学
（19027）
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
生物化学
（19029）
生物化学
生物化学
生物化学
生物化学
（19029）
生物化学
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
（19029）
生物化学
生物化学
（19029）
生物化学
生物化学
（19038）
生物化学
（19030）
生物化学
（19030）
生物化学
（19030）
生物化学
（19030）
生物工程
（15171）
生物工程
（15172）
生物工程
（15172）
生物工程
（15176）
生物工程
（15181）
生物工程
（15172）
生物工程
（15176）
生物信息学
（45271）
生物信息学
（45254）
生物信息学
（45254）
生物信息学
（45257）
生物物理学
（22958）
生物物理学
（22961）
生物物理学
生物物理学
（22958）
生物物理学
（22958）
生物物理学
生物物理学
（22958）
生物物理学
（22958）
生物物理学
（22961）
癌症生物学
（20088）
癌症生物学
（20080）
细胞生物学
（27282）
临床试验
临床试验
（138）
临床试验
（138）
发育生物学
（14135）
生态学
（21380）
流行病学
（2067）
进化生物学
（25764）
遗传学
（16328）
基因组学
（23806）
免疫学
（19004）
微生物学
（43137）
分子生物学
（18323）
神经科学
（94957）
古生物学
（712）
病理学
（3028）
药理学与毒理学
（5188）
生理学
（8268）
植物生物学
（16254）
科学传播与教育
（2115）
合成生物学
（4640）
系统生物学
（10373）
动物学
（2423）
关键词：珊瑚全共生体 · 微型真核生物共生体 · 含质体生物 · 绿藻属 · 珊瑚虫球菌类 · 宿主特异性
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.20.759601v1?rss=1