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Hirudo verbana 是一种实验室常用的药用水蛭，广泛用于神经生物学、神经修复、宿主—微生物共生及吸血行为研究。本文介绍了取自商业供应商养殖个体的 H. verbana 基因组及注释资源。基因组组装由 PacBio HiFi 和 Hi-C 数据支持；同时，基于同一批五种组织来源的 RNA 制备样品，分别生成了 Illumina RNA-seq 和 PacBio Kinnex Iso-Seq 数据。该资源包括一个主核基因组组装，含 14 条染色体尺度的支架序列（177.66 Mb）、40 条保留的非主记录（3.14 Mb）、一个 19,644 bp 的线粒体基因组模型、重复序列注释，以及 17,789 个基因模型和 30,131 个转录本。主组装的支架 N50 为 13.70 Mb，Merqury 共识 QV 为 63.49；基于 lophotrochozoa odb12 的 BUSCO 分析显示，完整 BUSCO 占比为 92.3%。Hi-C 和比较分析支持该组装的染色体尺度组织结构，而靶向验证则发现局部连接处存在不确定性，尤其是在 Chr04 上。通过共享标识符，该资源关联了基因组序列、转录组证据、可变转录本模型、功能注释及模型级溯源信息，可支持 H. verbana 中的模型评估、序列检索以及分子和比较分析。
*Hirudo verbana* 是一种实验室用药用水蛭，应用于神经生物学、神经修复、宿主—微生物共生及吸血行为研究。我们提供了一套基因组与注释资源，所用 *H. verbana* 来自商业供应商。基因组组装由 PacBio HiFi 和 Hi-C 数据支持；Illumina RNA-seq 与 PacBio Kinnex Iso-Seq 数据则来自同一批五种组织来源 RNA 制备物的配对等分样本。该资源包括一个主核基因组组装，包含 14 条染色体尺度的支架（177.66 Mb）、40 条保留的非主组装记录（3.14 Mb）、一个 19,644 bp 的线粒体基因组模型、重复序列注释，以及 17,789 个基因模型和 30,131 条转录本。主组装的支架 N50 为 13.70 Mb，Merqury 共识 QV 为 63.49；基于 lophotrochozoa odb12 数据集评估，BUSCO 完整率为 92.3%。Hi-C 和比较分析支持该组装的染色体尺度组织结构；靶向验证则揭示了局部连接位点的不确定性，尤其是在 Chr04 上。统一的标识符将基因组序列、转录组证据、可变转录本模型、功能注释和模型级溯源信息相互关联，支持在 *H. verbana* 中开展模型评估、序列检索以及分子和比较分析。
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关键词：药用水蛭 · 染色体级基因组组装 · 转录组资源 · Hi-C测序 · 基因注释
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.15.759518v1?rss=1