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长期脑电图(EEG)监测是啮齿动物癫痫研究的核心,但由于记录时长可达数百至数万动物小时,人工审阅十分耗时。已发表的自动检测器在其开发数据集上表现良好,但通常是固定模型,可能无法适应其他实验室的电极、动物或噪声条件。我们推出了 NED-Net,这是一款用于训练和维护癫痫发作检测器的开源软件。它以经审阅的候选事件作为训练标签,在记录过程中实时运行检测,并随着注释的累积进行重新训练。在一个小鼠队列上训练的检测器(标注了 867 次癫痫发作)经人工审阅 171 个检测结果后,精确率达到 93.6%。将该检测器原样应用于使用相同采集系统的第二个队列时,检测结果大多为癫痫发作(审阅的 13 个结果中有 12 个),但各动物的召回率差异显著(中位数为 10%);11 只动物中有 4 只未检测到任何参考性惊厥发作。使用第二个队列的注释进行重新训练后,惊厥发作召回率从 15% 提高至 64%,且每只动物至少检测到一次参考发作。在未用于训练的记录中,75% 的检测结果为癫痫发作,22 次参考发作中检测到 14 次;而源模型和未使用这些动物数据训练的模型均未检测到任何发作。NED-Net 支持在本地记录数据上评估和调整检测器。
marco.ledri{at}med.lu.se
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摘要
长期脑电图(EEG)监测是啮齿动物癫痫研究的核心,但人工审阅十分耗时,因为记录时长可达数百至数万动物小时。已发表的自动检测器在其开发数据集上表现良好,但通常是固定模型,未必能适应其他实验室的电极、动物或噪声条件。我们推出 NED-Net——一款用于训练和维护癫痫发作检测器的开源软件。该软件以经过审阅的候选事件作为训练标签,可在记录过程中实时运行检测,并随着标注数据的累积进行再训练。在一个小鼠队列(867 次已标注癫痫发作)上训练的检测器,经人工审阅 171 个检测结果后,精确率达到 93.6%。将该检测器原样应用于使用同一采集系统的第二个队列时,检测结果大多为癫痫发作(审阅的 13 个结果中有 12 个),但各动物的召回率差异显著(中位数为 10%);11 只动物中有 4 只未检测到任何参照性癫痫发作。使用第二个队列的标注数据进行再训练后,强直阵挛性发作的召回率从 15% 提升至 64%,且每只动物至少检测到一次参照性癫痫发作。在未用于训练的记录中,75% 的检测结果为癫痫发作,22 次参照性癫痫发作中检测到 14 次;而源模型和未使用这些动物数据训练的模型均未检测到任何发作。NED-Net 支持对检测器进行评估,并使其适应本地记录数据。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://doi.org/10.5281/zenodo.23315438
https://github.com/EpilepsyCenter/NED-Net
已声明的资助信息
瑞典研究理事会,
https://ror.org/03zttf063,2022-01203
Olle Engkvist 建筑大师基金会,
,233-0293
Thorsten and Elsa Segerfalk 基金会,
Åke Wiberg 基金会,
版权
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本预印本依据
CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议
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发布于 2026 年 10 月 21 日。
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NED-Net:一种用于啮齿动物脑电图事件检测的标注—训练循环
Mohd Yaqub MIR,Marco Ledri
bioRxiv
2026.10.15.759362;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.10.15.759362
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NED-Net:一种用于啮齿动物脑电图事件检测的标注—训练循环
Mohd Yaqub MIR,Marco Ledri
bioRxiv
2026.10.15.759362;
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https://doi.org/10.64898/2026.10.15.759362
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关键词:脑电图 · 癫痫发作检测 · 啮齿动物模型 · 机器学习 · 模型迭代训练
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.15.759362v1?rss=1