咖啡诱导的染色质结构变化与组蛋白H4K16低乙酰化相关

内容形式：摘要译文

组蛋白乙酰化在调控染色质结构和基因表达中发挥关键作用。在各种组蛋白乙酰化标记中，组蛋白 H4 第 16 位赖氨酸的乙酰化（H4K16ac）对于维持染色质组织结构尤为重要。我们此前通过基于质谱的组蛋白修饰谱分析发现，咖啡处理后 H4K16ac 水平降低。本研究探讨了咖啡对 H4K16ac 水平、染色质结构及基因表达的影响。Western blot 和免疫荧光分析证实，咖啡处理以细胞类型依赖的方式降低了 H4K16ac 水平。值得注意的是，在 HCT116 细胞中，H4K16ac 水平降低，而咖啡处理并未使 H3K27ac 水平下降。对 DAPI 染色细胞核进行定量分析发现，咖啡处理后核荧光强度变异系数显著升高，表明染色质结构发生改变。此外，整合公开的 H4K16ac 染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）数据与此前获得的 RNA 测序（RNA-seq）数据进行分析后发现，在 K562 细胞中，咖啡处理后 H4K16ac 富集基因出现了转录变化，其中包括 MYC 相关基因的下调。综上，这些发现表明，咖啡处理会引发染色质结构改变，并伴随 H4K16 低乙酰化，同时提示这些表观遗传变化可能与转录调控有关。

关键词：咖啡处理 · 组蛋白H4K16乙酰化 · 染色质结构 · 基因表达调控 · 表观遗传学

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.13.758977v1?rss=1