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摘要
引言:短期人源精密切割肾脏切片培养物(precision-cut kidney slices,PCKS)是一种易于操作的实验模型,其中包含处于原生解剖学环境中的成熟肾脏细胞类型,并可在体外进行操作。本研究采用基因组学工具分析PCKS对培养条件的反应,以及其用于研究肾小球疾病生物学的适用性。方法:采用空间转录组学和传统组织学方法,探讨培养基和氧合条件对PCKS存活率及基因表达的影响。同时,研究PCKS对IFNγ刺激的生物学反应,以及JAK1/2抑制剂巴瑞替尼对相关信号的抑制作用。结果:研究构建了全基因组范围的肾小球和肾小管-间质基因表达图谱,涵盖在不同培养基、不同氧合条件以及培养不同时间点下的PCKS。IFNγ可诱导肾小球中APOL1基因及蛋白的表达,而巴瑞替尼能够抑制这一作用。来源于多名供者的PCKS均表现出可重复的表达变化。结论:PCKS能够对IFNγ刺激产生可重复的反应,从而可用于在人组织模型系统中解析APOL1介导的肾小球疾病机制。对组织反应进行空间转录组学分析,有助于根据具体生物学问题优化培养基和氧合条件,从而改进PCKS系统。
作者声明不存在任何竞争性利益。
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关键词:精密切割肾脏切片 · 空间转录组学 · 肾小球疾病 · APOL1表达 · IFNγ信号通路 · 巴瑞替尼
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.16.759734v1?rss=1
来源出处
用于研究肾小球生物学与治疗反应的人源精准切割肾脏切片平台
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.16.759734v1?rss=1