WispLab：用于实验室图像和qPCR分析的开源浏览器工作台及基于参考的验证

内容形式：摘要译文

Western blot密度测定、组织学图像定量和相对qPCR分析均需要对区域、背景、阈值、归一化方法和统计比较方式作出选择。WispLab通过三个开源浏览器工作台将这些操作连接起来，并提供中英文界面、可见参数和可下载结果。常规定量处理在本地运行；Western blot工具中的可选外部视觉服务属于独立的数据传输路径。我们采用分别实现的参考程序和构造的输入数据，对选定操作进行了评估。对于包含21条测量泳道的4个公开Western blot图板，本地背景扣除后的净信号及参考泳道比值，在记录精度范围内均与Python参考程序一致。一个包含6条泳道的合成16位设计在两个文件中重复运行后，12项测量所得的净信号完全相同。组织学验证区分了35幅图像的成功处理结果，并在其中8幅图像和10个区域上进行了H-DAB面积比较。在校正区域匹配并使参考程序中的预处理步骤保持一致后，阳性面积分数的差异最大为0.152个百分点。qPCR验证采用一个公开的60孔板导出文件和一个构造示例；在修正Dunnett校正概率深尾部缺陷后，对固定源代码版本进行的新一轮运行通过了422项规定检查。这些测试证明，在指定输入和方法下，数值结果具有一致性；但并不代表其具备生物学准确性、临床有效性或优于现有软件的性能。源代码归档、比较记录和可复现绘图脚本记录了目前得到支持的主张以及仍待完成的验证工作。

关键词：Western blot定量 · 组织学图像分析 · 相对qPCR分析 · 生物医学图像处理 · 开源分析工具 · 参考验证

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.18.759898v1?rss=1