空间表观基因组学揭示与侵袭性前列腺癌生物学相关的祖源关联调控状态

由 root 提交于 周四, 10/22/2026 - 06:47
摘要

前列腺癌(PCa)具有显著的生物学异质性,包括不同人群在肿瘤侵袭性和临床结局方面的差异。尽管社会经济和环境因素会造成这些差异,肿瘤内在的调控程序也可能影响疾病行为。本研究探讨染色质调控差异是否促成了黑人与白人局限性 PCa 患者的不同肿瘤状态。我们对来自美国军警大学(USUHS)前列腺疾病研究中心和沃尔特·里德国家军事医学中心的黑人与白人患者前列腺切除术标本进行了空间染色质可及性分析(ATAC-seq);这些患者获得了同等的医疗服务。两个人群的肿瘤呈现出不同的染色质可及性图谱:黑人患者的肿瘤中,与染色质结构调控因子 CTCF 相关的基序可及性降低,而与上皮—间质转化及炎症程序相关的基序富集。随后,我们通过对 99 例前列腺切除术标本进行免疫组织化学分析,独立验证了 CTCF 表达降低这一发现。这些结果揭示了局限性 PCa 中与人群相关的染色质调控差异,并提示 CTCF 相关调控的改变、炎症信号传导及上皮可塑性可能促成生物学异质性,进而构成与祖源相关的 PCa 健康差异背后的因素。

前列腺癌(PCa)具有显著的生物学异质性,包括与人群相关的肿瘤侵袭性及临床结局差异。尽管社会经济和环境因素促成了这些差异,但肿瘤内在的调控程序也可能影响疾病行为。在本研究中,我们探讨了染色质调控差异是否促成了局限性前列腺癌黑人和白人男性之间不同的肿瘤状态。我们对接受前列腺切除术的黑人和白人患者标本进行了空间染色质可及性分析(ATAC-seq);这些患者均在前列腺疾病研究中心(Center for Prostate Disease Research,隶属美国军警卫生科学大学)和沃尔特·里德国立军事医学中心接受了同等的医疗服务。两个人群的肿瘤呈现出不同的染色质可及性图谱:黑人患者肿瘤中与染色质构象调控因子CTCF相关的基序可及性降低,而与上皮—间质转化及炎症程序相关的基序富集。随后,我们在99份前列腺切除术标本中通过免疫组织化学独立验证了CTCF表达降低的现象。这些发现揭示了局限性前列腺癌中与人群相关的染色质调控差异,并提示CTCF相关调控异常、炎症信号传导及上皮可塑性可能参与了导致前列腺癌存在族群依赖性差异的生物学异质性。

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关键词:前列腺癌 · 空间表观基因组学 · 染色质可及性 · CTCF调控 · 肿瘤侵袭性

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.16.753149v1?rss=1