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摘要：研究动机： 疟疾传播周期在三个相互作用的生物系统之间呈现时间组织性：寄生虫、脊椎动物宿主和蚊媒。寄生虫发育、宿主生理以及媒介行为的节律共同调控感染动力学、传播过程和针对特定发育阶段的抗疟干预措施的疗效。然而，由于时间分辨组学数据集分散于不同物种、实验范式和分析框架之中，且缺乏用于比较分析的统一资源，因此连接这些节律的分子架构仍难以进行系统研究。研究结果： 我们开发了 PlasmoRhythm，这是一个经整理的数据库，整合了来自 15 项研究的 67 个转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据集，涵盖疟原虫属物种、哺乳动物宿主和按蚊媒介的 1,126 个采样事件。经标准化的元数据以及由 JTK_CYCLE、ARSER、Lomb–Scargle 和 meta2d 函数获得的节律性分析结果，支持对分子谱进行交互式跨研究检索。专门设计的功能模块可用于探索具有节律性的毒力因子和抗疟药物互作因子，从而为围绕疟疾传播周期开展假设生成提供统一框架。可用性： PlasmoRhythm 可通过 https://project.iith.ac.in/cgntlab/PlasmoRhythm/ 免费访问。
摘要：
研究动机：疟疾传播周期在三个相互作用的生物系统之间按时间有序地展开：寄生虫、脊椎动物宿主和蚊媒。寄生虫发育、宿主生理以及媒介行为的节律共同调控感染动态、传播过程和阶段特异性抗疟干预措施的疗效。然而，由于时间分辨组学数据分散于不同物种、实验范式和分析框架之中，且缺乏用于比较分析的统一资源，连接这些节律的分子架构仍难以进行系统解析。
研究结果：我们开发了 PlasmoRhythm，这是一个经过整理的数据库，整合了来自15项研究的67个转录组、蛋白质组和代谢组数据集，涵盖疟原虫属物种、哺乳动物宿主和按蚊媒介的1,126个采样事件。经统一处理的元数据，以及通过 JTK_CYCLE、ARSER、Lomb-Scargle 和 meta2d 函数获得的节律性分析结果，支持对分子特征开展跨研究交互式查询。专门设计的模块可用于探索具有节律性的毒力因子和抗疟药物相互作用因子，为围绕疟疾传播周期开展假设生成提供统一框架。
资源获取：PlasmoRhythm 可通过 https://project.iith.ac.in/cgntlab/PlasmoRhythm/ 免费访问。
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关键词：疟疾 · 昼夜节律 · 节律性组学 · 多组学数据库 · 疟疾传播周期
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.11.758397v1?rss=1