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功能数据广泛应用于众多领域。对于重复测量中收集的功能数据,一种建模方法是纵向功能主成分分析(LFPCA),该方法能够分解多个层面的变异。然而,现有的 LFPCA 估计方法在处理大规模或高维数据集时,计算开销可能较大。本文提出快速广义纵向功能主成分分析(广义 LFPCA),这是一种新颖的估计方法:沿功能域对数据进行分箱,并在每个箱内拟合边际混合模型。模拟结果表明,与现有方法相比,所提方法的速度提升了数个数量级,同时保持了相近的准确性,从而使 LFPCA 能够扩展至观测采样更密集、样本量更大的数据集。我们将所提方法应用于深部脑刺激(DBS)开启和关闭状态下的神经元放电率数据建模,以考察该干预如何调节群体水平的神经元活动。结果表明,绝大多数神经元间变异可由四个主成分解释;这些主成分与神经元放电的个体差异以及所研究的手臂操作范式相关。我们还发现,DBS 会显著增加放电活动的变异性,这可能是由部分神经元对 DBS 产生反应、放电增强所驱动的。这一发现此前的分析未曾揭示。补充材料中提供了实现所提方法并运行模拟研究的代码。
快速广义纵向函数主成分分析及其在群体水平神经元动力学中的应用 | bioRxiv
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快速广义纵向函数主成分分析及其在群体水平神经元动力学中的应用
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Kelly A
Duffy,
Nidhi
Pai,
David
Schneck,
Gleb
Kozienko,
Lvpiao
Zheng,
Annette
Xenopoulos-Oddsson,
Jing
Wang,
Luke A
Johnson,
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Jerrold
Vitek,
Mark
Fiecas,
Erjia
Cui,
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758639
Kelly A Duffy
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功能数据广泛收集于多个领域。一种用于对重复测量所收集的功能数据进行建模的方法是纵向功能主成分分析(LFPCA),该方法能够在多个层次上分解变异。然而,对于大规模或高维数据集,现有的 LFPCA 估计方法在计算上可能负担沉重。在此,我们提出快速广义纵向功能主成分分析(fast generalized LFPCA),这是一种新的估计技术,通过沿功能域对数据进行分箱,并在每个数据箱处拟合边际混合模型来实现。模拟结果表明,与现有技术相比,所提出的方法在达到相似准确性的同时,计算速度提高了几个数量级,从而使 LFPCA 能够扩展至观测采样更加密集且样本量更大的数据集。我们应用所提出的技术,对深部脑刺激(DBS)开启和关闭状态下的神经元放电率数据进行建模,以研究该干预措施如何调节群体水平的神经元活动。结果表明,神经元之间绝大多数的变异可以由四个主成分解释;这些主成分分别与神经元放电的个体差异以及所研究的手臂运动范式有关。我们还发现,DBS 显著增加了放电活动的变异性,这可能是由放电增加所驱动的。
作为对 DBS 做出响应的部分神经元中的现象,这是一项以往分析未能获得的新发现。补充材料中提供了实现所提出方法并开展模拟研究的代码。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
基金资助信息
美国国家神经疾病与卒中研究所,
R01NS058945,
R37NS077657,
R01NS037019,
P50NS123109,
R01NS110613,
R01NS117822
版权
本预印本的版权归作者/资助方所有;其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 10 月 18 日。
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《快速广义纵向函数主成分分析及其在群体水平神经元动力学中的应用》
Kelly A. Duffy、Nidhi Pai、David Schneck、Gleb Kozienko、Lvpiao Zheng、Annette Xenopoulos-Oddsson、Jing Wang、Luke A. Johnson、Jerrold Vitek、Mark Fiecas、
Erjia Cui
bioRxiv
2026.10.12.758639;
doi:https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758639
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快速广义纵向函数主成分分析及其在群体水平神经元动力学中的应用
Kelly A Duffy、Nidhi Pai、David Schneck、Gleb Kozienko、Lvpiao Zheng、Annette Xenopoulos-Oddsson、Jing Wang、Luke A Johnson、Jerrold Vitek、Mark Fiecas、Erjia Cui
bioRxiv
2026.10.12.758639;
doi:https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758639
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关键词:纵向功能主成分分析 · 广义纵向功能主成分分析 · 神经元群体动力学 · 深部脑刺激 · 神经元放电变异性
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.12.758639v1?rss=1