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肠道微生物组受到环境因素和宿主遗传因素的共同塑造。鉴定特定宿主基因座对于理解微生物组相关性状的遗传力至关重要。St6galnac1 基因编码一种参与黏蛋白 O-糖基化的唾液酸转移酶。Tonnele 等（2025）使用禁食动物的盲肠样本，发现包含 St6galnac1 基因的基因座与副普雷沃氏菌属（Paraprevotella）的丰度显著相关。这一关联在三个队列中得到重复验证，并与人类研究中发现的、功能相关的唾液酸转移酶基因 ST6GAL1 与副普雷沃氏菌属之间的关联相呼应。鉴于微生物组分析对采样部位、进食状态和分析框架等因素具有敏感性，对这些发现进行独立重复验证十分重要；同时，明确该关联能否推广至其他条件，还是高度局限于特定环境，也同样重要。在本研究中，我们使用了174只采样前未经禁食的异质性群体（HS）大鼠的粪便样本（而非盲肠样本）开展重复验证分析。对粪便样本进行16S rRNA基因测序，并采用考虑数据组成性的分析方法分析微生物群落结构。针对 Tonnele 等（2025）研究中与副普雷沃氏菌属关联最显著的单核苷酸多态性（SNP）位点，对这些大鼠进行基因分型。采用校正性别、队列和遗传亲缘关系的线性混合模型，检验基因型与副普雷沃氏菌属丰度之间的关联。我们成功重复验证了 St6galnac1 与副普雷沃氏菌属之间的关联（p=0.015）。这些发现支持 St6galnac1 与副普雷沃氏菌属之间的关联在不同采样策略和实验条件下具有稳健性。
肠道微生物组受到环境因素和宿主遗传因素的共同塑造。鉴定特定的宿主基因座对于理解微生物组相关性状的遗传性至关重要。St6galnac1 基因编码一种参与黏蛋白 O-糖基化的唾液酸转移酶。Tonnele 等（2025）利用禁食动物的盲肠样本，发现包含 St6galnac1 基因的基因座与副普雷沃氏菌属（Paraprevotella）的丰度显著相关。该关联在三个队列中得到重复验证，并与人类研究中发现的、功能相关的唾液酸转移酶基因 ST6GAL1 与副普雷沃氏菌属之间的关联相呼应。鉴于微生物组分析对采样部位、进食状态和分析框架等因素的敏感性，对这些发现进行独立重复验证十分重要；同时，明确该关联能否推广至其他条件，还是高度依赖特定环境，也同样重要。在本研究中，我们使用了 174 只采样前未经禁食的异质性群体（HS）大鼠的粪便样本（而非盲肠样本），进行了重复验证分析。对粪便样本进行 16S rRNA 基因测序，并采用考虑组成型数据特性的分析方法评估微生物群落结构。针对 Tonnele 等（2025）研究中与副普雷沃氏菌属关联最显著的单核苷酸多态性（SNP）位点，对这些大鼠进行了基因分型。采用校正性别、队列和遗传亲缘关系的线性混合模型，检验基因型与副普雷沃氏菌属丰度之间的关联。我们成功重复验证了 St6galnac1 与副普雷沃氏菌属之间的关联（p=0.015）。这些发现支持 St6galnac1 与副普雷沃氏菌属之间的关联在不同采样策略和实验条件下具有稳健性。
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关键词：宿主遗传效应 · 肠道微生物组 · St6galnac1基因 · 副普雷沃氏菌属 · 遗传关联重复验证 · 异质性群体大鼠
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.09.758003v1?rss=1