通过靶向隐匿性半胱氨酸实现对脑啡肽的变构共价抑制

内容形式：摘要译文

沙利度胺衍生的 cereblon（CRBN）调节剂是临床应用影响最为显著的靶向蛋白降解疗法之一，可重新引导 CRL4-CRBN E3 泛素连接酶降解驱动疾病的新底物。目前所有靶向 CRBN 的 IMiD 和 CELMoD 均作用于同一个正构口袋，因此 CRBN 的构象空间在药理学上基本未得到开发。通过基于半胱氨酸的化学蛋白质组学筛选，我们鉴定出可与 Cys287 结合的共价配体；Cys287 位于一个隐蔽的变构口袋中，与正构位点相距较远。我们的先导化合物 VVD-105917 可广谱抑制 IMiD/CELMoD 驱动的新底物降解。冷冻电镜结构显示，共价结合 Cys287 可将 CRBN 锁定在开放的非活性构象，并解析出此前未曾观察到的 N 端片段和传感环。顺序孵育实验表明，构象变化取决于配体的添加顺序，说明即使 CELMoD 能强效驱动 CRBN 闭合，这一效应仍可被变构结合所逆转。近期报道的一种作用于同一口袋的配体却产生了相反效果：它促进而非阻止 CRBN 闭合。这表明，Cys287 位点的作用机制可在相反效应之间切换。这些发现确立了共价化学蛋白质组学作为发现并调控 E3 连接酶构象开关的一种策略。

关键词：脑啡呤（CRBN） · 变构抑制 · 共价配体 · 化学蛋白质组学 · E3泛素连接酶 · 靶向蛋白降解

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.10.758245v1?rss=1