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内容形式:摘要译文
摘要 上呼吸道(URT)微生物组在呼吸系统健康中发挥着至关重要的作用,其中,较大年龄儿童(5—14岁)是细菌向低龄儿童(<5岁)传播的重要储存宿主。然而,这一年龄组的上呼吸道微生物组特征尚未得到充分表征,尤其是其与条件致病菌肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)定植的关系。为填补这一空白,我们分析了在冈比亚134名5—14岁健康儿童的8次随访中采集的上呼吸道样本,采用依赖培养的方法检测肺炎链球菌,同时利用非培养依赖的16S rRNA测序技术表征微生物组。16S rRNA测序结果显示,链球菌属(Streptococcus)和普雷沃菌属(Prevotella)是微生物组的优势组成类群。整合纵向采样数据后,我们观察到微生物组在时间上具有不稳定性,其组成模式随时间频繁转换。肺炎链球菌定植的上呼吸道样本与莫拉菌属(Moraxella)、链球菌属和嗜血杆菌属(Haemophilus)丰度升高相关,而未定植样本则富集颗粒链菌属(Granulicatella)和丝杆菌属(Filifactor)。与未定植样本相比,肺炎链球菌定植还与较低的香农多样性相关。年龄和季节是微生物组组成最主要的决定因素;随着年龄增长,嗜血杆菌属和莫拉菌属等分类群的检出率及丰度均下降,而革兰氏阳性分类群主要在旱季富集。这些发现为认识冈比亚较大年龄儿童的上呼吸道微生物组提供了新的见解,并提示颗粒链菌属和丝杆菌属可能有助于抵抗肺炎链球菌定植。
关键词:上呼吸道微生物组 · 肺炎链球菌定植 · 儿童菌群 · 16S rRNA测序 · 微生物多样性 · 菌群纵向动态
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.04.756419v1?rss=1