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诱导虫瘿形成的蜂类正成为研究植物与昆虫协同进化、寄主操控、寄主植物适应及物种形成的新兴模式生物，但大多数谱系仍缺乏染色体水平的基因组资源。蓝莓茎瘿蜂（blueberry stem gall wasp，BSGW），Hemadas nubilipennis（膜翅目：刻腹小蜂科），原产于北美，可在矮丛蓝莓（Vaccinium angustifolium）和高丛蓝莓（V. corymbosum）上诱导形成虫瘿。近年来，BSGW在栽培高丛蓝莓生产中的种群密度已达到暴发水平。鉴于（a）其生物学特征主要基于与天然矮丛蓝莓相关的种群开展研究，（b）基因组资源的缺乏限制了比较分析，以及（c）栽培高丛蓝莓上的种群代表了一次近期的寄主转换，我们利用采自野生矮丛蓝莓的BSGW构建了该物种首个染色体水平的基因组。BSGW基因组由5条染色体尺度的支架序列组成，总长度为1.08 Gb（N50 = 218 Mb），是小蜂总科已知的第二大基因组。比较分析表明，基因组大小的变异主要由转座元件的扩增驱动（R = 0.96，p < 0.001），且BSGW基因组中未分类转座元件的比例较高。基因体甲基化具有保守性，富集于广泛表达的核心基因的外显子中，并与基因密度相关。线粒体基因组（18,697 bp）呈现广泛的基因重排，且COI序列显示其与地理上相距较远的种群之间存在4.35.4%的序列分化，提示其可能为一个隐存种复合群。此外，我们组装了内共生菌沃尔巴克氏体（Wolbachia pipientis，A超群）近乎完整的基因组，该基因组编码可能与孤雌生殖相关的PifA和PifB效应蛋白。这些资源为群体基因组学研究、分类学修订及应用管理奠定了基础，同时为深入了解……提供了见解基因组结构、表观遗传学与共生体相互作用。
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生于矮丛蓝莓（Vaccinium angustifolium）上的蓝莓茎瘿蜂 Hemadas nubilipennis（膜翅目：刻腹小蜂科）的染色体水平基因组揭示重复序列驱动的基因组扩张
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诱导虫瘿形成的蜂类正逐渐成为研究植物与昆虫协同进化、寄主操纵、寄主植物适应及物种形成的模式生物，但大多数谱系仍缺乏染色体水平的基因组资源。蓝莓茎瘿蜂（blueberry stem gall wasp，BSGW），学名 Hemadas nubilipennis（膜翅目：瘿金小蜂科），原产于北美洲，可在矮丛蓝莓（Vaccinium angustifolium）和高丛蓝莓（V. corymbosum）上诱导形成虫瘿。近年来，BSGW 在高丛蓝莓栽培生产中的种群密度已达到暴发水平。鉴于（a）既有生物学研究主要基于与天然矮丛蓝莓相关的种群，（b）基因组资源的缺乏限制了比较分析，以及（c）栽培高丛蓝莓上的种群代表了近期发生的寄主转换，我们利用采自野生矮丛蓝莓的 BSGW 构建了首个染色体水平基因组。BSGW 基因组由五条染色体尺度的支架序列组成，总长为 1.08 Gb（N50 = 218 Mb），是已知小蜂总科中第二大的基因组。比较分析表明，基因组大小变异主要由转座元件的扩增所驱动（R = 0.96，p < 0.001），其中 BSGW 含有较高比例的未分类转座元件（TE）。基因体甲基化具有保守性，富集于广泛表达的核心基因的外显子中，并与基因密度相关。
线粒体基因组（18,697 bp）呈现广泛的基因重排，COI序列显示其与地理位置相距较远的种群之间存在4.35.4%的分化，提示其可能构成一个隐存种复合群。此外，我们组装了内共生菌沃尔巴克氏体（Wolbachia pipientis，A超群）的近完整基因组，该基因组编码可能与孤雌生殖相关的PifA和PifB效应蛋白。这些资源为群体基因组学研究、分类修订及应用管理奠定了基础，同时为理解基因组结构、表观遗传学及共生体相互作用提供了新的认识。
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发布于2026年9月26日。
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蓝莓茎瘿蜂的染色体水平基因组，
低丛蓝莓（Vaccinium angustifolium）上的 Hemadas nubilipennis（膜翅目：刻腹小蜂科）揭示了重复序列驱动的扩张
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Sheina B. Sim
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2026.09.21.753281；
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https://doi.org/10.64898/2026.09.21.753281
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低丛蓝莓（Vaccinium angustifolium）上蓝莓茎瘿蜂 Hemadas nubilipennis（膜翅目：刻腹小蜂科）的染色体水平基因组揭示了重复序列驱动的扩张
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Soham Mukhopadhyay,
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2026.09.21.753281；
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关键词：蓝莓茎瘿蜂 · 染色体水平基因组 · 转座元件扩增 · 基因体甲基化 · 隐存种复合群 · 沃尔巴克氏体
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.21.753281v1?rss=1