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甲型流感病毒（IAV）是一种重要的人畜共患病原体，可感染多种脊椎动物宿主。本研究聚焦于推断一组新型IAV的进化历史。这组病毒分离自新大陆蝙蝠，利用非典型宿主受体；我们还推断了它们与唾液酸结合型IAV之间的关系。关于这些新型亚型何时出现，以及与唾液酸结合型流行毒株相比，自然选择如何作用于它们，目前所知甚少。目前，学界对于蝙蝠究竟是一个独特但丰度较低的IAV谱系的自然储存宿主，还是流感病毒在近期从其常见宿主范围内的某一物种溢出后迅速进化，尚未达成共识。通过分析各基因片段的系统发育关系，我们希望厘清蝙蝠IAV的进化历史。本研究旨在推断非典型蝙蝠IAV与唾液酸结合型IAV的分化时间；识别蝙蝠IAV与有代表性的唾液酸结合型IAV样本所受选择作用的模式，以确定基因组范围适应的潜在特征；并重建祖先状态转变，以推断哪些宿主类群先于病毒溢出至蝙蝠。本研究分别对每个IAV基因组片段进行分析，采用最小二乘分子定年、贝叶斯离散性状祖先宿主重建和分支-位点选择检验。结果表明，非典型蝙蝠IAV在100至200年前从主要IAV谱系中分化，这支持其具有较为久远的进化历史，而非源于近期溢出事件。然而，对分化时间、选择压力和祖先宿主的推断在不同基因组片段之间并不一致，这表明蝙蝠IAV经历了片段特异性的进化历史。综合而言，这些发现表明，非典型】【。蝙蝠甲型流感病毒（IAV）代表一个深度分化的谱系，其进化历史复杂，涉及片段特异性选择和宿主转换动态。
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甲型流感病毒（IAV）是一种重要的人畜共患病原体，可感染广泛的脊椎动物宿主。在本研究中，我们重点推断一组从新大陆蝙蝠中分离出的新型 IAV 的进化历史；这些病毒利用一种非经典宿主受体，并推断其与唾液酸结合型 IAV 之间的关系。关于这些新型亚型何时出现，以及与唾液酸结合型病毒相比，选择如何作用于它们，目前知之甚少。
流行毒株。当前，学界对于蝙蝠究竟是一个独特但丰度较低的甲型流感病毒（IAV）谱系的自然储存宿主，还是流感病毒在近期从其通常宿主范围内的某个物种发生溢出后经历了快速进化，仍存在分歧。通过分析各节段的系统发育关系，我们希望阐明蝙蝠IAV的进化历史。我们的目标是推断非经典蝙蝠IAV与唾液酸结合型IAV的分化时间，鉴定与唾液酸结合型IAV代表性样本相比作用于蝙蝠IAV的选择模式，以识别潜在的全基因组适应特征，最后重建祖先状态转变，以推断在病毒溢入蝙蝠之前涉及哪些宿主分类群。为此，我们分别分析了IAV的每个基因组节段，采用了最小二乘分子定年、贝叶斯离散性状祖先宿主重建和分支-位点选择检验。我们的结果表明，非经典蝙蝠IAV在100—200年前从主要IAV谱系中分化出来，这支持其具有更为久远的进化历史，而非源于一次非常近期的溢出事件。然而，不同基因组节段在推断的分化时间、选择压力和祖先宿主方面存在不一致，这表明蝙蝠IAV经历了节段特异性的进化历史。综上，这些发现表明，非经典蝙蝠IAV代表一个深度分化的谱系，其复杂的进化历史涉及节段特异性选择和宿主转换动态。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
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发布于 2026 年 10 月 14 日。
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Austen Rowell，
Matthew G Johnson，
David Rasmussen，
Lisa M Bono
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2026.10.14.754429；
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https://doi.org/10.64898/2026.10.14.754429
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Austen Rowell，
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2026.10.14.754429；
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关键词：蝙蝠甲型流感病毒 · 病毒系统发育 · 片段特异性进化 · 宿主转换 · 自然选择 · 分子定年
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.14.754429v1?rss=1