动物近缘生物 Capsaspora owczarzaki 的亚细胞空间蛋白质组学

由 root 提交于 周日, 10/18/2026 - 20:47

内容形式:摘要译文

Capsaspora owczarzaki 是与动物亲缘关系最近的物种之一,也是一种日益便于实验研究的模式生物,可用于探究多细胞性的演化。然而,针对动物姐妹谱系的细胞生物学研究仍十分有限。亚细胞空间蛋白质组学(subcellular spatial proteomics,SSP)将细胞分级分离与高灵敏度质谱分析相结合,能够在单次实验中确定数千种蛋白质的亚细胞区室定位。为全面了解 Capsaspora 蛋白质组的亚细胞定位,我们采用非标记版本的 LOPIT-DC(Localisation of Organelle Proteins by Isotope Tagging after Differential ultraCentrifugation,即差速超速离心后通过同位素标记定位细胞器蛋白质)方法开展了 SSP 分析。我们共检测到 6,466 种蛋白质,占 Capsaspora 预测蛋白质组的 68.4%,并将其中 3,106 种蛋白质以高置信度定位至 13 个亚细胞区室。本研究提供了一套蛋白质组学数据集,可用于解析这一动物近缘物种的细胞区室化特征,并支持后续的演化、生物学及功能分析。我们鼓励有意在本研究正式发表前使用这些数据的研究者与我们联系,以避免研究内容重叠,并促进对该资源的协调使用与合作研究。

关键词:亚细胞空间蛋白质组学 · 蛋白质亚细胞定位 · 细胞区室化 · 差速超速离心 · 质谱分析 · 动物近缘生物

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.13.758975v1?rss=1