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内容形式：摘要译文
过去20年来，综合人工湿地（ICW）理念已在爱尔兰应用于废水处理，为减少出水及受纳环境中的污染物和抗微生物药物耐药基因（ARGs）提供了一种基于自然的解决方案。然而，废水微生物群落仍未得到充分表征，其在处理过程中的动态变化也鲜有研究。本文对爱尔兰的四个人工湿地开展了非培养依赖型研究，旨在加深我们对废水处理过程中微生物动态变化的认识。我们对来自四个人工湿地的进水和出水样本进行了鸟枪法宏基因组测序；这些湿地分别处理农业、伴侣动物、工业和市政废水，样本均设生物学三重复，另设八个阳性对照和十个阴性对照，用于过滤和测序。采用 SqueezeMeta 进行端到端宏基因组分析。使用 GTDB-Tk 确认高质量宏基因组组装基因组（HQ-MAGs）的分类学定位。在 R 中进行去污染和统计分析。对共组装的重叠群进行筛查，以检测耐药基因、毒力相关序列和质粒相关序列。结果显示，处理前后分类学和功能特征均发生了具有统计学显著性的变化。与相应的进水群落相比，出水群落的物种丰富度总体更高，但不同地点的出水群落彼此之间更为相似。环境属（Legionella、Methylotenera、Thiothrix）的相对丰度增加了多个数量级，同时常见的粪便／人源指示菌属（Bacteroides、Lactococcus、Prevotella）丰度下降，ARGs 的去除率最高可达 80%。总之，我们的研究结果揭示了 ICW 的处理效能，表明其能够显著改变废水微生物组和 ARG】【。
减少。我们采用非培养依赖的方法获得了34个高质量宏基因组组装基因组（HQ-MAGs），其中包括19个潜在新分类单元，揭示了此前尚未表征的微生物多样性。这种多样性可能是爱尔兰环境所特有的，值得进一步研究。
关键词：人工综合湿地 · 废水处理 · 鸟枪法宏基因组 · 微生物群落动态 · 抗微生物药物耐药基因
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.08.750087v1?rss=1