摘要
栽培大丽花具有复杂的进化历史，这很可能是其花部形态多样性的驱动因素。既往研究曾提出，栽培大丽花可能是异源四倍体、同源四倍体，而其中一项研究则认为其为同源—异源八倍体。在本研究中，我们利用 PacBio HiFi 长读长测序数据和 Dovetail Omni-C 测序数据，对四倍体大丽花品种 Edna C 的基因组进行了组装与注释。基于亚基因组特异性重复序列的分区以及同源群内单拷贝基因树的构建，我们鉴定出 Edna C 为片段四倍体，并发现其具有同源多倍化和异源多倍化事件的特征。此外，我们还鉴定出一种栽培大丽花特异性着丝粒单体重复序列，该序列在大丽花 Edna C 和大丽花品种 Kelvin Floodlight 之间共有。基于所发现的三个主要染色体簇，我们提出，大丽花 Edna C 是一种具有同源多倍化和异源多倍化证据的片段四倍体。
栽培大丽花具有复杂的进化历史，这很可能是其花部形态多样性的驱动因素。既往研究曾提出，栽培大丽花可能是异源四倍体、同源四倍体，而有一项研究则认为其为同源—异源八倍体。在本研究中，我们利用 PacBio HiFi 长读长测序数据和 Dovetail Omni-C 测序数据，对一种四倍体的大丽花进行了基因组组装与注释。
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关键词：栽培大丽花 · 多倍体演化 · 片段四倍体 · 异源多倍化 · 基因组组装 · 着丝粒重复序列
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.24.740608v1?rss=1
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