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内容形式：摘要译文
尽管病毒受到抑制，长期接受抗逆转录病毒治疗（ART）的 HIV 感染者（PWH）仍因持续的免疫激活而面临较高的发病率和死亡率。已知的促成因素包括低水平 HIV 前病毒活性、部分由上皮屏障功能障碍引起的微生物易位、微生物组功能障碍以及合并感染。然而，这些因素如何相互作用，以及它们在不同组织区室中的主要分布位置，目前尚未得到充分阐明。本研究采用空间转录组学，分析了 10 名长期接受 ART 的 PWH 回肠（上皮、派尔集合淋巴结、固有层）和腹股沟淋巴结（B 细胞滤泡和 T 细胞区）中特定区室的转录程序。根据 CD4/CD8 比值将受试者分为低比值组和高比值组，其中低比值作为免疫激活及非艾滋病相关严重事件风险增加的替代指标。全局表达比较显示，五个区室中有四个区室在两组间存在显著差异。差异表达分析在五个区室中的四个区室共鉴定出 483 个差异表达基因，其中 T 细胞区的差异表达基因数量最多，固有层则未发现差异表达基因。基因集富集分析鉴定出 116 条富集通路，主要富集于低比值组，涉及免疫激活、感染相关及代谢程序；在所有区室中，派尔集合淋巴结表现出最广泛的转录差异。跨区室信号包括：低比值组中 ORMDL3 和 ARL17B 表达较高，提示线粒体应激和炎症小体激活；低比值组中 CCL3L3 和 FCMR 表达较低，提示免疫效应功能受损；此外，B 细胞滤泡与 T 细胞区之间的核糖体蛋白表达程序存在差异。
区。细胞去卷积分析发现，估算的免疫细胞比例存在区室特异性差异，且T细胞区的基因表达与HIV储存库指标以及微生物易位和免疫激活的血浆标志物显著相关。综上，这些发现支持将空间异质性免疫激活视为接受治疗的HIV感染者持续性免疫失调的特征，并为驱动该人群炎症的组织特异性机制提供了区室分辨的、可用于生成假设的证据。
关键词：HIV感染 · 空间转录组学 · 免疫激活 · 组织区室特异性 · CD4/CD8比值 · 抗逆转录病毒治疗
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.28.747869v1?rss=1