一套全面的HA标签PRC1工具箱,可在黑腹果蝇中实现标准化的染色质图谱分析和蛋白质组学分析。

由 root 提交于 周六, 10/17/2026 - 03:45
摘要

多梳组(Polycomb group,PcG)蛋白是一类在进化上保守的表观遗传调控因子,能够在发育过程中维持转录状态,其调控失常常见于疾病中。本研究利用 CRISPR/Cas9 介导的基因组工程,在黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中构建了一套全面的内源性 HA 标签等位基因资源,涵盖多梳抑制复合物 1(Polycomb Repressive Complex 1,PRC1)的核心组分及其他染色质调控因子。我们证实,内源性 HA 标签的引入不影响蛋白质表达、染色质定位及全基因组结合谱,从而能够使用同一种抗体对不同 PcG 亚基进行直接比较分析。蛋白质组学分析检出了经典与非经典 PRC1 复合物以及 PRC2 复合物的已知组分,并鉴定出其他 PcG 相关因子。值得注意的是,核孔复合物(nuclear pore complex,NPC)的多个组分被鉴定为 PcG 的相互作用因子,且遗传学分析证实了二者之间的功能性相互作用。该资源为多梳功能与染色质调控的标准化分析提供了一个平台,可便捷地扩展至其他染色质调控复合物,并应用于不同发育阶段。

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https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741006

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多梳组(Polycomb group,PcG)蛋白是一类在进化上保守的表观遗传调控因子,能够在发育过程中维持转录状态,其调控在疾病中常发生异常。本研究利用 CRISPR/Cas9 介导的基因组工程技术,在黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)中构建了一套全面的内源性 HA 标签等位基因资源,涵盖多梳抑制复合物 1(Polycomb Repressive Complex 1,PRC1)的核心组分及其他染色质调控因子。我们证明,内源性 HA 标签可保留蛋白质的表达、染色质定位及全基因组结合谱,从而能够使用同一种抗体分析不同的 PcG 亚基并进行直接比较。蛋白质组学分析鉴定到了经典及非经典 PRC1 和 PRC2 复合物的已知组分,并发现了其他 PcG 相关因子。值得注意的是,核孔复合物(nuclear pore complex,NPC)的多个组分被鉴定为 PcG 的相互作用因子,遗传学分析进一步证实了二者之间的功能性相互作用。该资源为多梳蛋白功能和染色质调控的标准化分析提供了一个平台,可轻松扩展至其他染色质调控复合物,并应用于不同发育阶段。

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Schuttengruber

bioRxiv

2026.07.27.741006;

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https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741006

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关键词:多梳抑制复合物1 · 内源性HA标签 · 染色质图谱 · 相互作用蛋白质组学 · 黑腹果蝇 · 表观遗传调控

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.27.741006v1?rss=1