- 7 次围观
尽管流感病毒具有很强的宿主转换倾向，但其宿主适应的进化机制仍不清楚。H3Nx流感病毒具有独特的广宿主特性，其长期存续的谱系可在禽类、人、猪、马和犬宿主中传播。我们利用13,295条H3Nx序列，量化了宿主特异性的适应性进化，并开发了一套分析流程，将重配事件映射至系统发育树，同时量化其统计不确定性。我们发现，尽管哺乳动物中的H3Nx病毒在血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）上经历适应性进化，但禽类中的病毒受到的定向选择极少。相反，禽类病毒谱系表现出较高的重配率，频繁产生短暂存续且快速更替的新重配谱系。所有禽类重配谱系中，有29.8%–47.4%在传播的第一年内即被淘汰，且重配在禽类中未显示出适合度优势。相比之下，猪中的重配谱系更有可能长期存续，表明重配在猪中可能普遍有益。禽类与哺乳动物病毒之间的片段特异性重配模式也存在差异：禽类病毒NA片段的重配频率高于预期，而猪病毒中的重配频率则低于预期。重配事件在哺乳动物物种间的宿主转换过程中富集，但在禽类物种间的宿主转换过程中并非如此，这表明重配可能在介导哺乳动物物种间的宿主转换方面最为有益。总体而言，我们的数据表明，宿主差异驱动流感病毒产生根本不同的进化结果：从其禽类储存宿主中以重配为主导的进化，转变为在哺乳动物中建立稳定传播后发生不同程度的适应性进化。
尽管流感病毒具有很强的宿主转换倾向，但其宿主适应背后的进化机制仍不明确。H3Nx流感病毒具有独特的广宿主性，其长期存续的谱系在禽类、人类、猪、马和犬宿主中传播。我们利用13,295条H3Nx序列，量化了宿主特异性的适应性进化，并开发了一套分析流程，用于将重配事件映射至系统发育树，同时评估统计不确定性。我们发现，尽管哺乳动物中的H3Nx病毒在血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）上经历了适应性进化，但禽类中的病毒几乎不受定向选择作用。相反，禽类病毒谱系表现出较高的重配率，频繁产生新的重配谱系，这些谱系仅短暂存续且更替迅速。所有禽类重配谱系中，有29.8%–47.4%在传播的第一年内被清除，且重配在禽类中未表现出适合度优势。相比之下，猪中的重配谱系更有可能长期存续，表明重配在猪中可能具有普遍的有利作用。禽类与哺乳动物病毒在基因组节段特异性的重配模式上也存在差异：禽类病毒中NA的重配频率高于预期，而猪病毒中则低于预期。重配事件在哺乳动物物种间的宿主转换中富集，而在禽类物种间的宿主转换中则未见富集，表明重配在介导哺乳动物物种间宿主转换方面可能最为有利。总体而言，我们的数据表明，宿主差异驱动流感病毒产生根本不同的进化结果：从其禽类储存宿主中以重配为主导的进化，转变为在哺乳动物中建立稳定传播后不同程度的适应性进化。
作者声明不存在利益冲突。
感谢您有意帮助传播有关以下内容的信息：
bioRxiv。
注意：请求您提供电子邮件地址，仅用于确认您是本文的发送者。
关键词：流感病毒 · 宿主适应 · 适应性进化 · 基因重配 · 跨物种传播 · 系统发育分析
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.15.751820v1?rss=1