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肽毒性是肽发现与治疗药物开发中的一项关键安全性和可开发性参数，但相关信息仍分散于各类数据库、文献资源和人工整理的数据集中。在此，我们提出 MAOMAO，这是一个由本体指导、面向 FAIR 原则的资源，整合并统一了来自 54 个来源的肽毒性数据。MAOMAO 包含涵盖七个毒性相关终点的 71,701 条独特肽序列，以 501,907 个序列—终点组合的形式呈现，并为各终点标注特异性的证据状态，对不可获取的信息进行显式编码。该资源整合了标准化术语、层次化毒性词汇体系、证据感知的状态判定、来源感知的元数据、41 种理化描述符、10 种蛋白质语言模型表征，以及独热编码基线。该资源还提供了基于不同数据划分策略和随机种子的终点特异性基准数据划分，可与数值表征配合复用。MAOMAO 为肽毒性研究和数据驱动的毒理学建立了一个可复用的框架。
david.medina{at}umag.cl
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肽毒性是肽发现与治疗药物开发中关乎安全性和可开发性的关键参数，然而，相关信息仍分散于各类数据库、文献资源和经整理的数据集中。本文介绍 MAOMAO，这是一个由本体指导、面向 FAIR 原则的资源，整合并协调了来自 54 个来源的肽毒性数据。MAOMAO 收录了涵盖七个毒性相关终点的 71,701 条独特肽序列，表示为 501,907 个序列—终点组合，并为各终点标注特定的证据状态，同时对不可用信息进行显式编码。该资源整合了标准化术语、层级式毒性词汇体系、证据感知的状态判定、包含来源信息的元数据、41 个理化描述符、10 种蛋白质语言模型表征以及独热编码基线。该资源针对不同数据划分策略和随机种子，提供了各终点专属的基准数据分区，可与数值表征配合复用。MAOMAO 为肽毒性研究和数据驱动的毒理学建立了一个可复用框架。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://zenodo.org/records/21584414
已声明的资助机构信息
国家研究与发展署，
，11250295
，FB0001
，AFB240001
，1230298
版权
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本预印本依据
CC-BY 4.0 国际许可协议
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发布于 2026 年 8 月 4 日。
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MAOMAO：一种由本体指导、符合 FAIR 原则的标准化肽毒性数据资源
Nicole
Soto-Garcia
,
Roberto
Uribe-Paredes
,
Leandro
Murgas
,
Karen
Orostica
,
Jorge
Gonzalez-Puelma
,
Marcelo
Navarrete
,
Frederic
Cadet
,
David
Medina-Ortiz
bioRxiv
2026.07.29.741655;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.07.29.741655
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MAOMAO：一种由本体指导、符合 FAIR 原则的标准化肽毒性数据资源
Nicole
Soto-Garcia
,
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Uribe-Paredes
,
Leandro
Murgas
,
Karen
Orostica
,
Jorge
Gonzalez-Puelma
,
Marcelo
Navarrete
,
Frederic
Cadet
,
David
Medina-Ortiz
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2026.07.29.741655;
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https://doi.org/10.64898/2026.07.29.741655
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关键词：肽毒性 · 数据整合 · 本体驱动标准化 · FAIR数据资源 · 毒理学基准数据 · 蛋白质语言模型表征
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.29.741655v1?rss=1