乳腺癌中 APOBEC3B mRNA 表达与基因组突变特征相关

内容形式：摘要译文

尽管筛查和治疗技术不断进步，乳腺癌仍是癌症相关死亡的主要原因之一。APOBEC酶，尤其是APOBEC3B（A3B），在多种癌症中呈上调表达，并促成一种特征性的C→T突变特征，该特征见于30%～50%的乳腺癌。然而，不同亚型中A3B突变特征与A3B表达之间的关系，以及由此产生的潜在生物学后果，尚未得到充分阐明。我们利用TCGA和ICGC数据集，分析DNA及RNA表达数据，以评估A3B mRNA表达与APOBEC富集评分之间的关系。通过通路富集分析（KEGG、GO和Reactome），鉴定与A3B高表达相关的生物学过程，并根据乳腺癌内在亚型（HR+/HER2−、HR+/HER2+、HR−/HER2+和TNBC）进行分层分析。在具有富集A3B突变基因组特征的肿瘤中，超过64%的肿瘤表现出高于中位数的A3B mRNA表达（p＜0.001）。A3B高表达肿瘤在药物代谢通路中表现出特异性改变。值得注意的是，我们观察到CYP2D6和CYP3A同工型表达降低，而这些酶是将他莫昔芬转化为其活性代谢物所必需的。相反，参与嘧啶代谢的基因，包括IMPDH1、NME1、TK1和DPYS，在A3B高表达肿瘤中呈下调。A3B表达升高与突变特征相关，并可能导致他莫昔芬活化受损及内分泌治疗耐药，同时产生对嘧啶类化疗药物的代谢脆弱性。靶向A3B或利用这些代谢依赖性，可能改善特定患者亚群的治疗应答。

关键词：乳腺癌 · APOBEC3B表达 · APOBEC突变特征 · 通路富集分析 · 药物代谢 · 他莫昔芬代谢

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.20.745899v1?rss=1