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衰老与蛋白质组重塑以及不溶性蛋白质的逐渐积累相关。鉴定随年龄富集并发生聚集的蛋白质,并评估能够调节其行为的化合物,可能有助于深入理解促进健康衰老的干预措施。在本研究中,我们提出了一种蛋白质组引导策略,用于鉴定与年龄相关的易聚集蛋白,并评估靶向秀丽隐杆线虫中保守蛋白的植物化学物。我们鉴定出一批蛋白质,其在老年线虫中的丰度较年轻线虫增加了四倍以上;其中许多蛋白质还在年龄相关不溶性蛋白质组中发生积累。随后,我们鉴定了这些蛋白质对应的人类直系同源蛋白,以开展比较分析。基于生物学相关性、结构保守性以及高置信度结构模型的可获得性,我们选取谷氨酰胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶-2(GFAT-2)进行分子对接。对15种植物化学物分别针对秀丽隐杆线虫GFAT-2及其人类直系同源蛋白GFPT1进行筛选后,槲皮素被鉴定为预测结合能力最强的化合物,并且与这两种蛋白均形成保守的相互作用。然而,用槲皮素处理线虫并未显著改变衰老过程中的全局蛋白质不溶性。这可能反映出槲皮素能够调节不适当的蛋白质-蛋白质相互作用,但不会显著影响总体聚集负荷。这些发现强调,有必要对有利的计算机模拟分子对接预测结果进行实验验证。更广泛而言,本研究提供了一个蛋白质组引导框架,可用于优先筛选与年龄相关的易聚集蛋白,将其作为维持衰老过程中蛋白质稳态的候选治疗靶点。
鉴定秀丽隐杆线虫衰老过程中保守的年龄相关聚集倾向蛋白,作为天然分子的靶标 | bioRxiv
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https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741274
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衰老与蛋白质组重塑及不溶性蛋白质的逐渐积累有关。鉴定随年龄富集且发生
研究其聚集并评估能够调节其行为的化合物,可能有助于深入了解促进健康衰老的干预措施。在此,我们报告了一种由蛋白质组指导的策略,用于鉴定与年龄相关的易聚集蛋白,并评估靶向秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中保守蛋白的植物化学物。我们鉴定出在老年线虫中的丰度较年轻线虫增加超过四倍的蛋白质,其中许多蛋白质还在与年龄相关的不溶性蛋白质组中发生积累;随后,我们鉴定了它们的人类直系同源蛋白,以进行比较分析。基于生物学相关性、结构保守性以及高置信度结构模型的可获得性,选择谷氨酰胺-果糖-6-磷酸氨基转移酶-2(GFAT-2)进行分子对接。针对秀丽隐杆线虫GFAT-2及其人类直系同源蛋白GFPT1对15种植物化学物进行筛选,结果显示槲皮素是预测结合能力最强的化合物,并且其与这两种蛋白均形成保守的相互作用。然而,用槲皮素处理线虫并未显著改变衰老过程中的全局蛋白质不溶性。这可能反映出槲皮素能够调节不适当的蛋白质-蛋白质相互作用,而不会显著影响总体聚集负担。这些发现强调了对有利的计算机模拟分子对接预测进行实验验证的必要性。更广泛地说,本研究提供了一个由蛋白质组指导的框架,用于优先筛选与年龄相关的易聚集蛋白,将其作为维持衰老过程中蛋白质稳态的候选治疗靶点。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
已声明的资助信息
生物技术部
,Ramalingaswami再入职资助项目(BT/RLF/Re-entry/31/2018)
版权
本预印本的版权所有者为
作者/资助方已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
该内容依据
CC-BY-NC-ND 4.0 International 许可协议
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发布于 2026 年 7 月 29 日。
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衰老过程中秀丽隐杆线虫中可被天然分子靶向的保守性年龄相关易聚集蛋白质的鉴定
Priyanka
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Masakapalli,
Prasad
Kasturi
bioRxiv
2026.07.28.741274;
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https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741274
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2026.07.28.741274;
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关键词:秀丽隐杆线虫 · 衰老相关蛋白聚集 · 蛋白质稳态 · 蛋白质组学 · 分子对接 · 槲皮素
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.28.741274v1?rss=1