了解哪些基因在何种细胞类型中发生可重复的失调，是减缓或逆转病理过程研究的基础。对于神经病理性疾病，这类研究主要依赖对单核RNA测序（snRNA-seq）数据进行差异表达分析。然而，这一策略面临实验和统计方面的挑战，限制了标志基因的可重复性。我们介绍一种名为共变投影分析（CoPA）的新策略，它结合了批量采样的优势与单细胞方法的精确性。CoPA将批量基因共表达模块投射到伪批量化的snRNA-seq细胞类型上，从而揭示高度可重复的基因组程序的细胞来源，以及这些程序在不同细胞类型中的相对重要性。通过使用差异CoPA（dCoPA）比较正常与病理人脑样本中的CoPA投影模式，我们识别出一些基因共表达模块：它们在阿尔茨海默病或精神分裂症患者的特定新皮层细胞类型中呈现一致且可重复的失调。我们通过一款名为CoPA Cabana的新型网页应用分享研究发现（https://oldhamlab.shinyapps.io/copacabana/）。
了解哪些基因在何种细胞类型中可重复地发生失调，是减缓或逆转病理过程的重要基础。对于神经病理学而言，这类研究主要依赖对单核RNA测序（snRNA-seq）数据进行差异表达分析。然而，这一策略面临实验和统计方面的挑战，限制了标志基因的可重复性。我们介绍了一种称为协变投影分析（
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关键词：共变投影分析（CoPA） · 单核RNA测序 · 基因共表达模块 · 细胞类型特异性基因失调 · 阿尔茨海默病 · 精神分裂症
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.25.747130v1?rss=1