SYNTAX解析雄激素受体近端互作组的基序与结构域语法

内容形式：摘要译文

受体的互作组通常以蛋白质列表的形式报告，但组织其构成的序列规则从未被解析出来。我们提出SYNTAX，这是一种对356类短线性基序和573个蛋白质结构域进行扫描的方法，可校正基序计数中由长度、负荷和简并性造成的偏差；我们将其应用于在三个亚细胞区室及雄激素时间序列中获得的4751个雄激素受体（AR）近邻互作蛋白（AR-PIPs）。AR的标志性共激活因子基序LXXLL是缺失最显著的一类，而其周围环境则呈现出一套驻留于无序区的信号传导“词汇”，包括SUMO化位点、SPOP和SIAH降解子以及核输入信号。去除偶然基序后，这一悖论便得到了解释。AR的共激活因子核心在信号传导外围中形成一个小型且富集9倍的内壳层。这种“语法”在雌激素受体β互作组中得以复现（r = 0.89），并可推广至5-HT2A血清素受体和EGFR。SYNTAX与预测性近邻蛋白质组（PPP）数据库相连接，后者是一个可查询的AR-PIP资源。

关键词：雄激素受体 · 蛋白质互作组 · 短线性基序 · 蛋白质结构域 · 序列语法 · 近邻蛋白质组

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.06.743244v1?rss=1