ζ病毒的实验表征与β类病毒样RNA的发现拓展了编码型环状RNA复制子的多样性

由 root 提交于 周六, 10/17/2026 - 20:58

内容形式:摘要译文

类病毒样RNA(viroid-like RNAs,vdlRNAs)是一类感染性因子,其特征是具有可折叠形成紧凑二级结构的单链环状基因组,且通常含有参与复制的自切割核酶。近期的宏转录组学研究拓展了多个生态位中已知vdlRNAs的多样性,并揭示了具有蛋白质编码能力的新型vdlRNAs类群,其中包括ζ病毒,其特征是在两种极性的RNA链中均具有编码无限串联重复蛋白的潜能。然而,除计算机分析鉴定外,此前尚无实验证据支持其存在及其分子特征。本研究鉴定了三种新的ζ病毒,并对其中一种土壤来源的ζ病毒进行了分子表征。此外,还发现了一种新型的具有编码能力的vdlRNAs,命名为β类病毒样RNA。与ζ病毒相似,β类病毒样RNA为环状RNA,两种极性的RNA链中均含有一个核酶和一个覆盖全长基因组的开放阅读框(ORF)。与ζ病毒不同,β类病毒样RNA的ORF并非无限延伸,但其长度超过单位长度的基因组。实验确认了ζ病毒和β类病毒样RNA均存在两种极性的环状RNA链、不存在DNA形式,且其核酶具有自切割活性,这些数据与对称滚环复制机制一致。在来自不同地理区域湿地的公开宏转录组数据集中,还鉴定出了更多ζ病毒和β类病毒样RNA,支持其广泛分布。16种ζ病毒含有多种自切割核酶,包括δ核酶、II型和III型锤头核酶、扭结核酶及发夹核酶,拓展了该类群已知的核酶多样性。总体而言,我们的结果提供了首个实验性的

ζ病毒和β类病毒样RNA的表征拓展了环状RNA复制子的多样性

关键词:类病毒样RNA · 编码型环状RNA · ζ病毒 · β类病毒样RNA · 自切割核酶 · 对称滚环复制

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.16.752053v1?rss=1