从FACS分选的B细胞和T细胞亚群中重建FACS分区的适应性免疫受体组库

内容形式：摘要译文

适应性免疫受体库测序（AIRRseq）对于理解免疫系统多样性及其与疾病动态的关系至关重要。将全部B细胞和T细胞划分为具有不同免疫学功能的主要亚群——IgM+与类别转换型B细胞（IgG+多于IgA+），以及CD4+与CD8+ T细胞——使研究者能够利用AIRRseq分析各细胞区室对整体免疫应答的独特贡献，这是其相较于传统混合样本测序流程的一项主要优势。然而，这些亚群的数据无法与绝大多数公开可用的AIRRseq数据直接比较；后者来自未经分选的B细胞和T细胞，因此存在重要的不兼容性。本研究针对不同个体，探究了从分选的B细胞和T细胞亚群中计算重建完整AIRRseq受体库的方法。研究人员利用免疫磁珠对外周血单个核细胞（PBMC）进行分选，阳性筛选出IgM+ B细胞亚群和CD4+ T细胞；随后提取基因组DNA，并对B细胞和T细胞受体进行测序。研究提出并评估了四种重建方法，通过与匹配的未分选受体库进行一致性比较，考察其对关键受体库特征的保留情况。结果表明，这些方法能够基于B细胞和T细胞亚群准确估算整体免疫受体库多样性，而仅仅汇集各子受体库的序列数据则无法实现这一点。

关键词：适应性免疫受体组库 · AIRR-seq · B细胞亚群 · T细胞亚群 · 免疫组库重建 · 受体多样性

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.13.746584v1?rss=1