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内容形式：摘要译文
慢性肾脏病（CKD）是一种进行性疾病，其特征为代谢功能障碍、线粒体功能受损、氧化应激和慢性炎症，最终导致不可逆的肾脏损伤。尽管我们对CKD病理生理学的认识不断加深，但针对这些相互关联的分子过程的有效疗法仍然有限。本研究开展了全面的基于数据非依赖采集（DIA）的蛋白质组学分析，以探究与CKD相关的分子改变，并评估DVA治疗的疗效。在包含三种治疗条件（DVA、KY和DVA+KY）的CKD模型中，同时设置疾病对照组和健康对照组，我们对全局蛋白质组变化进行了定量，并通过统计筛选（倍数变化≥2，p≤0.05）后进行K均值聚类（k=10）。不同蛋白质簇揭示了DVA治疗所引起的双向调节。值得注意的是，簇1由在CKD中表达下调、但在给予DVA后显著恢复的蛋白质组成；簇2则包括在CKD中升高、但受到DVA抑制的蛋白质。通路富集分析和网络分析显示，簇1蛋白质主要与线粒体功能、氧化磷酸化和代谢过程相关，而簇2蛋白质则富集于免疫信号传导、氧化应激、细胞骨架重塑和蛋白质稳态相关通路。在分子层面，DVA治疗恢复了关键的线粒体和代谢调节因子，包括电子传递链组分（如COX5A、NDUFS5、SDHB）及氧化还原稳态相关蛋白，表明细胞生物能量代谢得到恢复。与此同时，DVA抑制了炎症介质（STAT2、IFI47、GBP2）和氧化应激相关蛋白（CYBB，
PRDX5）以及与肾损伤相关的细胞骨架调节因子（ARHGEF12、FMNL2）。网络分析和Reactome分析进一步证实，发生协同调节的是相互关联的生物系统，而非孤立的蛋白质变化。总体而言，我们的研究结果表明，DVA具有双重治疗作用：一方面恢复关键的线粒体和代谢通路，另一方面抑制CKD中的炎症、氧化应激和细胞骨架失调。这种系统层面的蛋白质组重编程表明，DVA有望成为干预CKD的候选方案，并为理解疾病进展及治疗靶点提供了机制层面的见解。
关键词：慢性肾脏病 · DIA蛋白质组学 · 线粒体功能 · 氧化磷酸化 · Rho GTP酶 · 炎症信号传导
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.02.748845v1?rss=1