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人诱导多能干细胞（hiPSCs）广泛用于疾病建模和再生医学，但其应用价值取决于能否在长期培养过程中维持分子完整性。BCOR（BCL6 共抑制因子）突变是 hiPSC 培养过程中最常见的获得性变异之一，但其功能后果仍未得到充分认识。在此，我们发现，hiPSC 中的 BCOR 突变主要为截短型插入缺失突变，且富集于第 7 外显子，其突变图谱有别于癌症中观察到的模式。多组学分析显示，BCOR 缺失可引发广泛的染色质、转录组和蛋白质组重塑，并协同激活发育、多能性相关及线粒体代谢程序。为便于常规监测，我们开发了一种经济高效的 TaqMan qPCR 检测方法，可在多个独立细胞系中准确识别 BCOR 突变型 hiPSC。最后，我们证明，通过 CRISPR-Cas9 校正 BCOR 突变仅能部分恢复野生型分子状态，这凸显了对 hiPSC 培养物中的适应性突变进行早期检测和监测的重要性。
BCOR突变在人诱导多能干细胞中建立持久的培养适应状态 | bioRxiv
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BCOR突变在人诱导多能干细胞中建立持久的培养适应状态
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https://doi.org/10.64898/2026.09.04.739550
Cherif Badja
1
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Soraya Boushaki
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Yogesh Kumar
1
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Theodoros I Roumeliotis
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India Baker
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Brian Hendrich
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Jyoti Choudhary
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Gene Ching Cheik Koh
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Serena Nik-Zainal
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人诱导多能干细胞（hiPSC）广泛用于疾病建模和再生医学，但其应用价值取决于长期培养过程中能否维持分子完整性。BCOR（BCL6 共抑制因子）突变是 hiPSC 中最常见的培养获得性改变之一，但其功能后果仍未得到充分认识。在此，我们发现，hiPSC 中的 BCOR 突变主要为截短型插入缺失突变，且富集于外显子 7，形成了有别于癌症中所见突变的突变图谱。多组学分析表明，BCOR 缺失会引发广泛的染色质、转录组和蛋白质组重塑，并协同激活发育、多能性相关及线粒体代谢程序。为便于常规监测，我们开发了一种经济实用的 TaqMan qPCR 检测方法，可在不同独立细胞系中准确识别 BCOR 突变型 hiPSC。最后，我们证明，利用 CRISPR-Cas9 校正 BCOR 突变只能部分恢复野生型分子状态，凸显了在 hiPSC 培养过程中尽早检测并监测适应性突变的重要性。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://doi.org/10.1038/s41588-022-01147-3
https://doi.org/10.1016/j.xgen.2023.100280
https://doi.org/10.1038/s41588-022-01147-3
https://doi.org/10.1016/j.stem.2017.12.002
已申报的资助机构信息
杰弗里·谢基金会，
英国癌症研究高级临床科学家奖
，C60100/A23916
约瑟夫·施泰纳博士癌症研究奖（2019年）
巴瑟·格雷·普莱姆奖（2020年）
英国癌症研究先锋奖
，C60100/A23433
英国癌症研究大挑战546奖
，C60100/A25274
英国癌症研究早期检测项目奖
，C60100/A27815
英国国家健康与护理研究所（NIHR）548教授职位
，NIHR301607
NIHR剑桥生物医学研究中心
，BRC-1215-20014
，NIHR203312
版权
本预印本的版权归作者／资助方所有；作者／资助方已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
该文依据以下许可协议公开：
CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议
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发布于2026年9月7日。
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Choudhary
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Gene Ching Cheik
Koh
，
Serena
Nik-Zainal
bioRxiv
2026.09.04.739550；
DOI：
https://doi.org/10.64898/2026.09.04.739550
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Koh
，
Serena
Nik-Zainal
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2026.09.04.739550；
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关键词：人诱导多能干细胞 · BCOR突变 · 培养适应性 · 染色质重塑 · 多组学分析
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.04.739550v1?rss=1