结构普查揭示了倒数第二位残基类别与人类蛋白质组装体中N端埋藏程度之间的关联

内容形式：摘要译文

起始甲硫氨酸切除是最早发生的蛋白质修饰之一，但其与装配几何构型之间的关系尚不明确。研究测量了7,246个已提交的人类生物学组装体中成熟蛋白质首位残基的埋藏程度，共涵盖22,291条链级观测和1,191种蛋白质。在1,143种可分析蛋白质中，属于MetAP允许切除的倒数第二位残基序列类别的末端，其参与界面的频率低于属于MetAP不允许切除类别的末端（37.4%对47.4%；校正优势比为0.65，p = 7.2e-4）。经整理的加工注释未显示相应的埋藏差异；残基性质之间的相关性也使得无法将这种序列类别关联特异性地归因于iMet切除。分析发现264个参与界面的MetAP允许切除候选位点，且主要集中于细胞机器中。在对深埋的蛋白酶体位点进行完全重新计算的构象扫描中，相较于观察到甲硫氨酸的对照位点，模型中的甲硫氨酸容纳情况较不理想（重叠值中位数为−0.30对−1.12 Å，p = 0.0049），不过大多数可评分位点仍允许甲硫氨酸以不发生重叠的方式定位。因此，这项系统盘点揭示的是一种渐进式结构约束，而非普遍的空间位阻失败，并指出了值得优先研究的复合物，可在其中检验堆积改变、装配动力学、脂质化或N端甲基化的作用。

关键词：起始甲硫氨酸切除 · N端埋藏程度 · 蛋白质组装体 · MetAP底物特异性 · 结构约束

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.31.748389v1?rss=1