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内容形式:摘要译文
背景:GBA1变异是帕金森病(PD)的常见风险因素,但大多数变异的结构后果尚未得到表征。目前尚无集中式资源能够整合日益增多的葡萄糖脑苷脂酶(GCase)结构、化合物及PD相关变异。目的:开发一种交互式工具,将GBA1-PD相关错义变异映射至GCase结构,并同时展示其相互作用分子和治疗性化合物。方法:我们构建了GBAviewer,这是一个基于R/Shiny的网络服务器,将GBA1-PD Browser中的变异与晶体结构、冷冻电镜复合物、AlphaFold3模型及AlphaMissense评分进行整合。我们还使用AlphaFold3构建了一个推定的GCase–鞘脂激活蛋白C(Saposin C,SapC)–葡萄糖神经酰胺三元复合物模型。结果:GBAviewer可在三维结构中映射分布于GCase活性位点、LIMP-2和SapC结合表面、分子伴侣结合口袋及二聚化界面的变异。我们的三元复合物模型支持SapC与GCase活性位点入口结合,该区域聚集了多个临床意义未明的变异。结论:GBAviewer是一个可免费访问的GBA1变异结构分析平台,可为机制研究和治疗开发提供支持。访问地址:https://g-can.shinyapps.io/GBAviewer/
关键词:GBA1变异 · 帕金森病 · 葡萄糖脑苷脂酶 · 蛋白质结构数据库 · 变异结构映射 · 蛋白质复合物建模
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.05.749596v1?rss=1
来源出处
GBAviewer:帕金森病相关GBA1变异的结构数据库
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.05.749596v1?rss=1