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西高止山脉的尼尔吉里丘陵生活着多个历史上长期相互隔离的部落群体，其基因组历史尚未得到全面厘清。本研究结合广泛的欧亚人群参考面板，对尼尔吉里地区三大群体，即托达人、科塔人和库伦巴人的全基因组及完整线粒体基因组数据进行了综合分析。常染色体分析揭示了此前未被识别的精细尺度群体亚结构，其中科塔人和库伦巴人均可划分为两个遗传上不同的聚类（Kota1/Kota2和Kurumba1/Kurumba2）。主成分分析、ADMIXTURE分析和fineSTRUCTURE分析表明，托达人是尼尔吉里群体中遗传漂变最为显著的群体，而Kota2则表现出较高比例的南亚语系相关祖源。qpWave分析表明，这五个遗传聚类至少需要三支独立的祖源流才能解释，而qpAdm分析则依据翁奇人、印度河周缘人群以及西部草原青铜时代中晚期人群（Western SteppeMLBA）相关祖源，进一步区分了这些群体。在尼尔吉里各群体中，托达人的印度河周缘相关祖源比例最高，翁奇人相关祖源比例最低。Kurumba2、Kota1、Gaud和斯里兰卡维达人共享一种独特的祖源成分，提示印度洋南部区域存在更深层次的祖源联系。线粒体基因组揭示了强烈的奠基者效应及谱系特异性模式，包括托达人中的R5a2b、科塔人中的M3a1，以及库伦巴人中的多个M亚支和罕见的C4a2c1谱系。值得注意的是，此前在南印度研究不足的C4a2c1，在系统发育和古DNA层面均显示出与北亚及西伯利亚谱系的连续性。贝叶斯年代推断表明，该谱系于全新世早中期（约7000年前）进入印度次大陆，随后在约5000年前之后发生局部多样化。总体而言，这些发现揭示了全新世长距离……的复杂历史母系基因流以及随后由隔离驱动的分化，为理解南印度部落人群的基因组历史提供了新的见解。
西高止山脉的尼尔吉里丘陵生活着多个历史上长期相互隔离的部落群体，其基因组历史尚未得到全面厘清。本研究结合广泛的欧亚人群参考面板，对尼尔吉里地区三大群体，即托达人、科塔人和库伦巴人的全基因组及完整线粒体基因组数据进行了综合分析。常染色体分析揭示了此前未被识别的精细尺度群体亚结构，其中科塔人和库伦巴人均可划分为两个遗传上不同的聚类（Kota1/Kota2和Kurumba1/Kurumba2）。主成分分析、ADMIXTURE分析和fineSTRUCTURE分析表明，托达人是尼尔吉里群体中遗传漂变最为显著的群体，而Kota2则表现出较高比例的南亚语系相关祖源。qpWave分析表明，这五个遗传聚类至少需要三支独立的祖源流才能解释，而qpAdm分析则依据翁奇人、印度河周缘人群以及西部草原青铜时代中晚期人群（Western SteppeMLBA）相关祖源，进一步区分了这些群体。在尼尔吉里各群体中，托达人的印度河周缘相关祖源比例最高，翁奇人相关祖源比例最低。Kurumba2、Kota1、Gaud和斯里兰卡维达人共享一种独特的祖源成分，提示印度洋南部区域存在更深层次的祖源联系。线粒体基因组揭示了强烈的奠基者效应及谱系特异性模式，包括托达人中的R5a2b、科塔人中的M3a1，以及库伦巴人中的多个M亚支和罕见的C4a2c1谱系。值得注意的是，此前在南印度研究不足的C4a2c1，在系统发育和古DNA层面均显示出与北亚及西伯利亚谱系的连续性。贝叶斯年代推断表明，该谱系于全新世早中期（约7000年前）进入印度次大陆，随后在约5000年前之后发生局部多样化。总体而言，这些发现揭示了全新世长距离……的复杂历史
母系基因流以及随后由隔离驱动的分化，为理解印度南部部落人群的基因组历史提供了新的见解。
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关键词：群体遗传学 · 尼尔吉里部落 · 群体亚结构 · 祖源推断 · 线粒体谱系 · 全新世基因流
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.09.750264v1?rss=1