厌氧氨氧化细菌生物化学中的新成员:一种多结构域HAO样蛋白

由 root 提交于 周六, 10/17/2026 - 01:36
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厌氧氨氧化(anammox)细菌是全球氮循环的重要参与者,负责将铵和亚硝酸盐直接转化为氮气。厌氧氨氧化细菌具有独特的特征,例如特化的细胞区室——厌氧氨氧化体。与其他厌氧氨氧化细菌一样,Candidatus(Ca.)Brocadia pituitae 的基因组编码多种羟胺氧化还原酶(HAO)旁系同源蛋白,这些酶常被认为负责催化厌氧氨氧化循环中的大多数反应。Ca. B. pituitae 的其中一种 HAO 旁系同源蛋白由 840 个氨基酸组成,本文将其命名为 BpMHAO。该蛋白因其前所未见的结构域组织方式而引人注目,其中包含一个多铜氧化酶样(MCo 样)结构域,随后连接一个 HAO 样结构域。序列与结构分析表明,该 MCo 样结构域与小型漆酶家族具有同源性。光谱表征显示出独特的紫外–可见吸收光谱,初步将其归属于 T3 中心,而电子顺磁共振(EPR)光谱则证实了 T1、T2 和 T3 铜中心的存在。酶学研究表明,该蛋白具有有限的漆酶活性和氧依赖性亚铁氧化酶活性。另一方面,对含有重组 HAO 样结构域的大肠杆菌(Escherichia coli)和奥奈达希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)细胞提取物进行的酶活性测定显示,以甲基紫精为电子供体时,该结构域表现出较强的羟胺还原酶活性。我们的结果表明,BpMHAO 可能通过将羟胺转化为肼而在厌氧氨氧化过程或反应中发挥作用。这一特性可能对厌氧氨氧化细菌具有重要意义,其作用方式包括:i)将错误生成的非期望产物羟胺转化为肼,从而减少羟胺并使其能够用于厌氧氨氧化反应;或 ii)利用来自……的羟胺外部介质中作为铵的替代物,将肼直接输送至该循环的最后一步,从而绕过该循环的前几个步骤。

f.folgosa{at}itqb.unl.pt

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厌氧氨氧化(anammox)细菌是全球氮循环中的重要参与者,负责将铵和亚硝酸盐直接转化为氮气。厌氧氨氧化细菌具有独特的特征,例如特化的细胞区室——厌氧氨氧化体。与其他厌氧氨氧化细菌一样,Candidatus(Ca.)Brocadia pituitae 的基因组编码多种羟胺氧化还原酶(HAO)旁系同源蛋白,这些酶通常被认为负责催化厌氧氨氧化循环中的大多数反应。Ca. B. pituitae 的其中一种 HAO 旁系同源蛋白由 840 个氨基酸组成,本文将其命名为 BpMHAO。该蛋白因其前所未见的结构域组织方式而引人注目,其中包含一个类多铜氧化酶(MCo-like)结构域,其后连接一个类 HAO 结构域。序列与结构分析表明,该类 MCo 结构域与小型漆酶家族同源。光谱表征显示出一种独特的紫外–可见吸收光谱,初步归属于 T3 中心,而电子顺磁共振(EPR)光谱则证实了 T1、T2 和 T3 铜中心的存在。酶学研究表明,该蛋白具有有限的漆酶活性和氧依赖性亚铁氧化酶活性。另一方面,对含有重组类 HAO 结构域的大肠杆菌(Escherichia coli)和奥奈达希瓦氏菌(Shewanella oneidensis)细胞提取物进行的酶活性测定显示,以甲基紫精为电子供体时,该结构域具有较强的羟胺还原酶活性。我们的结果表明,BpMHAO 可能通过将羟胺转化为肼而在厌氧氨氧化过程/反应中发挥作用。这一特性可能对厌氧氨氧化细菌具有重要意义,具体途径包括:i)通过将其转化,减少因错误合成而产生的不需要的羟胺

转化为肼,使其能够用于厌氧氨氧化反应;或 ii)利用外部介质中的羟胺替代铵,将肼直接输送至该循环的最后一步,从而绕过其初始步骤。

利益冲突声明

作者声明不存在利益冲突。

已声明的资助方信息

葡萄牙科学与技术基金会

,10.54499/2021.04625.BD

,EXPL/BIA-BQM/0768/2021

,MOSTMICRO-ITQB 研发单位(UIDB/04612/2020;UIDP/04612/2020)及(UID/04612/2025,UID/PRR/4612/2025)

,LS4FUTURE 联合实验室(LA/P/0087/2020)

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厌氧氨氧化细菌生物化学中的新成员:一种多结构域 HAO 样蛋白

Susana F

Fernandes

,

Catarina Martins

Alves

,

Catarina M.

Paquete

,

Ricardo O.

Louro

,

Filipe

Folgosa

bioRxiv

2026.07.28.741245;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741245

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厌氧氨氧化细菌生物化学中的新成员:一种多结构域类羟胺氧化还原酶(HAO)蛋白

Susana F Fernandes,

Catarina Martins Alves,

Catarina M. Paquete,

Ricardo O. Louro,

Filipe Folgosa

bioRxiv

2026.07.28.741245;

doi:

https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741245

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关键词:厌氧氨氧化 · 多结构域HAO样蛋白 · 多铜氧化酶 · 羟胺还原酶活性 · 肼代谢 · 铜中心光谱表征

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.28.741245v1?rss=1