对着推断树吠叫：利用祖先重组图检测犬类基因组中的选择信号

内容形式：摘要译文

识别选择作用的分子靶标是进化研究的一项重要目标。既往研究采用汇总统计量，识别与犬（Canis lupus familiaris）由狼驯化而来相关的遗传信号。近期的计算方法进展使基于祖先重组图（Ancestral Recombination Graphs，ARGs）的新方法成为可能；这类图可对样本在整个基因组中的谱系关系进行建模。我们利用祖先重组图，在一组具有广泛地理代表性的40只村犬中，与41只狼相比，识别出285个异常位点，其平均最近共同祖先时间（TMRCA）异常短。既往研究识别的位点富集于观测到的TMRCA比值分布两端，表明多种不同方法在识别犬类选择信号方面得出了相互趋同的结果。我们识别出的异常位点距许多此前与驯化相关联的基因不超过50 kb，其中包括参与神经发育和行为的基因。本研究为未来深入解析犬类早期进化过程中受到选择的具体分子变化，提供了一组经过精细筛选的候选区域。

关键词：祖先重组图 · 犬类驯化 · 自然选择信号 · 最近共同祖先时间 · 群体基因组学

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.02.748875v1?rss=1