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心脏 GSDMD 研究主要聚焦于心肌细胞。我们在两个单核队列和一个 GeoMx 空间队列中量化了供体层面的内皮细胞减去心肌细胞差异，并保留各检测方法特有的量纲。42/42、38/38 和 27/32 位供体的内皮细胞区室中 GSDMD 表达较高；事后分析显示，其在相应队列内有符号对比值分布中的排名分别位于第 94.9、95.1 和 97.4 百分位。尽管在全转录组范围内，正向变化和供体间完全一致并非 GSDMD 所独有，但这一由假设驱动选定的目标基因在参考背景和检测模态迥异的情况下仍保持较高排名。固定的八转录本面板同时包含内皮细胞偏移和心肌细胞偏移的成员，这不支持整个面板存在统一的方向性偏移，也不支持简单的检测失败。GeoMx 提供了区分度最高的转录组背景，但仍受细胞组成影响。因此，在多个心脏队列中，内皮细胞区室的 GSDMD 转录本水平反复高于心肌细胞区室，这表明仅以心肌细胞为基础解读人类心脏中的 GSDMD 转录信号并不完整。
心脏 GSDMD 研究主要聚焦于心肌细胞。我们在两个单核队列和一个 GeoMx 空间队列中量化了供体层面的内皮细胞与心肌细胞之间的差异，并保留各检测方法特有的尺度。在这三个队列中，内皮细胞区室的 GSDMD 水平均分别高于 42/42、38/38 和 27/32 名供体的心肌细胞区室；事后分析显示，其在相应队列内有符号对比度分布中的排名分别位于第 94.9、95.1 和 97.4 百分位。尽管正向差异和所有供体方向一致并非全转录组范围内独有的现象，但作为基于假设选定的目标基因，GSDMD 在参考背景和检测模态截然不同的情况下仍保持较高排名。固定的八转录本面板中既有内皮细胞中表达偏高的成员，也有心肌细胞中表达偏高的成员，这不支持整个面板存在一致的方向性偏移，也不支持存在简单的检测失败。GeoMx 提供了区分度最高的转录组背景，但仍容易受到细胞组成的影响。因此，在不同的人类心脏队列中，内皮细胞区室的 GSDMD 转录本水平反复高于心肌细胞区室，这表明仅从心肌细胞角度解读人类心脏中的 GSDMD 转录本信号是不完整的。
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关键词：GSDMD · 心脏内皮细胞 · 心肌细胞 · 基因表达分析 · 单核转录组 · 空间转录组
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.09.06.749635v1?rss=1