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环境DNA(eDNA)日益广泛地用于监测陆生哺乳动物多样性,但影响此类系统中检出概率的因素仍缺乏充分认识。淡水饮水点及其周边的基质是采集陆生生物多样性的极具潜力的eDNA采样点,尤其适用于干旱和半干旱景观。然而,预计eDNA检出概率在很大程度上取决于动物与这些水源点采样基质接触的频率和强度。我们结合相机陷阱与eDNA宏条形码技术,在南非草原水源点(博察拉诺野生动物保护区)开展了数周调查,覆盖湿季和旱季,以探究影响哺乳动物eDNA检出的因素,并评估物种行为(与水体的接触强度)、物种性状、环境协变量以及基质类型(水体与沉积物)对eDNA检出概率的影响。相机陷阱共记录到30种哺乳动物,而eDNA宏条形码检测到40种,其中25种为两种方法共同检出。体型增大可提高相机陷阱的检出概率,但不会提高eDNA宏条形码的检出概率。eDNA检出受到营养级的显著影响:与杂食动物和食肉动物相比,草食动物的eDNA检出率显著更高。此外,行为上的涉水接触强度、社会群体规模、到访频率以及观测到的个体数量越高,eDNA检出概率越大;而自相应物种上次到访以来经过的时间越长,eDNA检出概率越低。对水体内部开展的精细尺度空间分析表明,eDNA沉积具有高度局部性。基质类型的影响十分显著,沉积物样本反映了更长期的哺乳动物活动情况,而水样则反映了较近期的相互作用,并且对环境条件更加敏感。在野生动物活动路径采集的样本呈现出相似的模式:营养级和与活动路径的空间邻近性均会提高检出率。
稀树草原水坑中哺乳动物的环境 DNA 检测受物种生态、行为和基质类型的影响 | bioRxiv
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Tamara Schenekar
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https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758424
Irmgard Sedlmayr¹
奥地利格拉茨大学生物学系;
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Janine Baxter²
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南非国家生物多样性研究所,国家动物园,南非比勒陀利亚;
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1
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环境 DNA(eDNA)日益广泛地用于监测陆生哺乳动物多样性,但影响此类系统中检出概率的因素仍缺乏充分认识。淡水饮水点内及周边的基质是采集 eDNA 的特别理想地点,有望捕获陆生生物多样性,尤其是在干旱和半干旱景观中。然而,在这些水源地,eDNA 检出概率预计会显著受到动物与采样基质接触频率和强度的影响。
我们结合相机陷阱与 eDNA 宏条形码技术,在南非草原水源地(Botsalano 野生动物保护区)开展了数周调查,覆盖雨季和旱季;并评估了物种行为(与水的接触强度)、物种性状、环境协变量以及基质类型(水体与沉积物)对哺乳动物 eDNA 检出概率的影响。相机陷阱共检出 30 种哺乳动物,而 eDNA 宏条形码技术检出 40 种,其中 25 种为两种方法共同检出。
体型增大提高了相机陷阱的检出概率,但未提高 eDNA 宏条形码技术的检出概率。营养级显著影响 eDNA 检出情况,其中食草动物表现出
eDNA 检出率显著高于杂食动物和食肉动物。行为性水体接触强度、群体规模、到访频率以及观察到的个体数量越高,eDNA 检出概率也越高;而自相应物种上次到访以来经过的时间越长,检出概率则越低。对水体内部进行的精细空间分析显示,eDNA 的沉积具有高度局部性。基质类型产生了显著影响:沉积物样本反映了更长期的哺乳动物活动,而水样则反映了较近期的互动,且对环境条件更为敏感。在野生动物路径采集的样本也呈现出类似模式,营养级和距路径的空间距离均会提高检出率。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
基金信息声明
FWF 奥地利科学基金会,
,10.55776/35059-B
版权
本预印本的版权归作者/资助方所有;作者/资助方已授予 bioRxiv 永久展示本预印本的许可。
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发布于 2026 年 10 月 13 日。
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Irmgard
Sedlmayr
,
Janine
Baxter
,
Rebecca
Garbett
,
Itumeleng
Letlojane
,
Monica
Mwale
,
Byron
Weckworth
,
Tamara
Schenekar
bioRxiv
2026.10.12.758424;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758424
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物种生态学、行为和基质类型影响稀树草原水坑处哺乳动物环境DNA的检出
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,
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,
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,
Itumeleng
Letlojane
,
Monica
Mwale
,
Byron
Weckworth
,
Tamara
Schenekar
bioRxiv
2026.10.12.758424;
doi:
https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758424
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关键词:环境DNA(eDNA) · 哺乳动物多样性监测 · DNA宏条形码 · 物种行为 · 基质类型
原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.12.758424v1?rss=1