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斑马贻贝（Dreissena polymorpha）是一种造成广泛经济损失和生态破坏的入侵物种。本研究鉴定并表征了斑马贻贝小RNA（sRNA）和RNA干扰（RNAi）通路的关键组分。与其他软体动物一样，斑马贻贝具有丰富的微小RNA（miRNA）和Piwi相互作用RNA（piRNA）相关分子机制，但缺乏产生小干扰RNA（siRNA）所必需的部分经典因子，或这些因子已发生改变。具体而言，斑马贻贝Dicer序列中，对底物连续加工能力至关重要的保守DEAD盒基序存在氨基酸替换；此外，该物种还缺乏R2D2等部分相关辅助因子。我们对分离的体细胞组织（闭壳肌）及完整个体（包括生殖系）中的小RNA进行了测序，鉴定出保守的及新发现的miRNA和多种piRNA序列，但仅发现少量内源性siRNA。为确定其保留的sRNA相关分子机制能否被利用以启动基因沉默，我们将靶向多个基因的双链RNA（dsRNA）注射至斑马贻贝闭壳肌中。注射的靶向rpn8的dsRNA降低了rpn8 mRNA水平，并被加工为类似内源性miRNA和piRNA的sRNA。这两类sRNA的水平均与mRNA敲低程度相关，提示它们可能如其他研究中所见，协同启动RNAi。靶向其他基因的dsRNA产生的效果不一，提示在该实验体系中触发RNAi反应可能需要满足特定条件。本研究表征了斑马贻贝的内源性sRNA通路，证实dsRNA能够诱导RNAi，并为进一步优化、建立针对这一危害性入侵物种的基于RNAi的遗传操作工具奠定了基础。
入侵物种斑马贻贝（Dreissena polymorpha）小非编码 RNA 通路的表征 | bioRxiv
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Dreissena polymorpha
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斑马贻贝（
Dreissena polymorpha
）是一种造成广泛经济和生态损害的入侵物种。本研究鉴定并表征了斑马贻贝小 RNA（sRNA）和 RNA 干扰（RNAi）通路的关键组分。与其他软体动物一样，斑马贻贝具有丰富的微小 RNA（miRNA）和 Piwi 相互作用 RNA（piRNA）相关分子机器，但缺乏产生小干扰 RNA（siRNA）所需的经典因子，或这些因子已发生改变。具体而言，斑马贻贝的
贻贝 Dicer 序列中，在底物持续加工能力所必需的保守 DEAD 盒基序内存在氨基酸替换，且该生物还缺乏 R2D2 等一些相关辅助因子。我们对分离的体细胞组织（闭壳肌）和完整个体（包括生殖系）中的小 RNA 进行了测序，鉴定出保守及新型 miRNA，以及多种 piRNA 序列，但仅发现少量内源性 siRNA。为确定其现存的小 RNA（sRNA）机制是否仍可被利用以启动基因沉默，我们向斑马贻贝的闭壳肌注射了靶向多个基因的双链 RNA（dsRNA）。注射的靶向 rpn8 的 dsRNA 降低了 rpn8 mRNA 水平，并被加工为类似于内源性 miRNA 和 piRNA 的 sRNA。这两类 sRNA 的水平均与 mRNA 敲低程度相关，提示它们可能如其他研究所见，协同启动 RNA 干扰（RNAi）。靶向其他基因的 dsRNA 所产生的效果不一，提示在该试验中，触发 RNAi 反应可能需要满足特定条件。我们的研究表征了斑马贻贝的内源性 sRNA 通路，证实 dsRNA 能够诱导 RNAi，并为进一步优化和建立针对这一危害严重的入侵物种的 RNAi 遗传操控工具奠定了基础。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1467755/
已声明的资助方信息
明尼苏达水生入侵物种研究中心，MAISRC 子项目 36
战略环境研究与开发计划，https://ror.org/00ew61678，RC23-3845
版权
本预印本的版权归作者／资助方所有，版权持有人已授权 bioRxiv 永久展示该预印本。
本预印本依据知识共享署名 4.0 国际许可协议（CC BY 4.0）开放使用。
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发布于2026年7月11日。
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）的小非编码RNA通路表征
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Daryl M.
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bioRxiv
2026.07.10.737777；
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2026.07.10.737777；
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关键词：斑马贻贝 · 小非编码RNA · RNA干扰 · 微小RNA · PIWI相互作用RNA · 基因沉默
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.10.737777v1?rss=1