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病毒基因组数据能够解析狂犬病传播过程并指导疫情应对，但监测工作往往受限于如何将合适的样本从偏远采集点运送至实验室，而非测序能力不足；这一过程可能需要数月时间。在本研究中，我们表明，用于狂犬病诊断的侧向层析装置（lateral flow devices，LFDs）也可作为基因组样本，从而无需额外采集样本，便可将诊断与基因组采样整合到同一工作流程中。我们在实验室和现场条件下评估了LFDs和FTA卡用于狂犬病病毒基因组回收的效果。在菲律宾民马罗巴（MIMAROPA）各岛省开展监测期间，以金标准直接荧光抗体试验（direct fluorescent antibody test，DFAT）为参照（n = 319），Bionote LFD的敏感性为99.1%，特异性为100%；其结果在采样后中位数1天即可获得，而DFAT确认则需5天。在模拟现场储存条件的实验室环境中（室温或37摄氏度，最长21天），残留的LFD材料和FTA卡均支持近乎完整的基因组测序，但基因组回收率会随着储存时间延长而下降，尤其是在较高温度下。与此一致，现场采集的LFD在室温储存23天以内仍可获得近乎完整的基因组，但储存29—77天后只能获得部分基因组，这表明其实际可用时间窗口约为3周。重新利用已嵌入诊断流程的LFDs，为无需额外采样或冷链支持的分散式基因组监测提供了一条切实可行的途径。FTA卡可作为互补性的保存选项，而进一步优化样本制备、核酸提取和储存条件，可能有助于提高基因组回收率并延长可测序时间窗口。
1
热带医学研究所（RITM）；现场流行病学培训项目校友基金会有限公司（FETPAFI）；
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Criselda Bautista
1
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Criselda Bautista
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Mary Elizabeth Miranda
2
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Daria L. Manalo
3
热带医学研究所（RITM）；
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Shynie Vee M. Telmo
4
区域动物疾病诊断实验室；
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Gian Rei Mangcucang
2
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Sheryl Pablo
2
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Michael Ralph Tanedo
2
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Eleanor M. Rees
5
格拉斯哥大学；MRC-格拉斯哥大学病毒研究中心；
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Sandeep Kasaragod
6
格拉斯哥大学
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Nai Rui Chng
6
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Katie Hampson
6
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Kirstyn Brunker
5
格拉斯哥大学；MRC-格拉斯哥大学病毒研究中心；
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通信作者：
kirstyn.brunker{at}glasgow.ac.uk
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病毒基因组数据能够解析狂犬病传播过程并指导疫情应对，但监测工作通常受到的限制并不是测序能力不足，而是难以将合适的样本从偏远采集地点运送至实验室；这一过程可能需要数月时间。我们在此表明，用于狂犬病诊断的侧向层析检测装置（LFD）也可作为基因组样本，从而将诊断与基因组采样整合到单一工作流程中，无需额外采集样本。我们在实验室和现场条件下评估了 LFD 和 FTA 卡对狂犬病病毒基因组的回收效果。在菲律宾民马罗巴群岛省份开展监测期间，Bionote LFD 以直接荧光抗体检测作为金标准（n = 319）时，敏感性为 99.1%，特异性为 100%，检测结果的获得时间中位数为
采样后1天，而DFAT确认则需5天。在模拟现场储存条件的实验室环境中（室温或37摄氏度，最长达21天），残留的LFD材料和FTA卡均支持近乎完整的基因组测序，但随着储存时间延长，基因组回收率下降，尤其是在较高温度下。与此一致的是，现场采集的LFD样本在室温储存23天以内仍可获得近乎完整的基因组，但储存29至77天后仅能获得部分基因组，表明其实际可用窗口约为三周。重新利用已纳入诊断流程的LFD，为在无需额外采样或冷链条件下开展分散式基因组监测提供了一条切实可行的途径。FTA卡则提供了互补的保存方案；此外，进一步优化样本制备、核酸提取和储存条件，或可提高基因组回收率并延长可测序窗口。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
脚注
https://github.com/RAGE-toolkit/RABV-LFD-sequencing
基金资助信息声明
医学研究委员会，
，MR/X002047/1
，MR/R025649/1
版权
本预印本的版权所有者为作者/资助方，其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。
该预印本依据CC-BY 4.0国际许可协议提供。
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发布于2026年10月14日。
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Bea
Crisostomo
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Criselda
Bautista
，
Mary Elizabeth
Miranda
，
Daria L.
Manalo
，
Shynie Vee M.
Telmo
，
Gian Rei
Mangcucang
，
Sheryl
Pablo
，
Michael Ralph
Tanedo
，
Eleanor M.
Rees
，
Sandeep
Kasaragod
，
Nai Rui
Chng
，
Katie
Hampson
，
Kirstyn
Brunker
bioRxiv
2026.10.12.758520；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758520
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侧向流动装置可加速狂犬病病毒基因组监测
Bea
Crisostomo
，
Criselda
Bautista
，
Mary Elizabeth
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Shynie Vee M.
Telmo
，
Gian Rei
Mangcucang
，
Sheryl
Pablo
，
Michael Ralph
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，
Eleanor M.
Rees
，
Sandeep
Kasaragod
，
Nai Rui
Chng
，
Katie
Hampson
，
Kirstyn
Brunker
bioRxiv
2026.10.12.758520；
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.10.12.758520
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关键词：狂犬病病毒 · 病毒基因组监测 · 侧向层析装置 · 基因组测序 · 样本保存
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.12.758520v1?rss=1