发育转录因子功能性无序区域的生成式设计

内容形式：摘要译文

蛋白质结构设计的快速发展尚未惠及内在无序区域（intrinsically disordered regions，IDRs）。这在很大程度上是由于我们尚未充分理解IDR序列如何编码功能。在本研究中，我们以干细胞分化为模型，绘制转录因子RUNX2的IDR中具有功能的序列特征。我们发现，在成骨过程中，RUNX2需要其C端IDR来结合染色质并调控基因表达。出人意料的是，线性IDR序列并非必需；相反，构象集合的特征能够预测其功能。基于生物物理学原理，我们开发了一种用于理性设计IDR的算法，并利用该算法从头生成了具有功能的IDR。总体而言，这些结果阐明了转录因子IDR在染色质结合中的核心作用，并将生成式蛋白质设计拓展至折叠蛋白质组之外。

关键词：内在无序区域 · 转录因子 · RUNX2 · 染色质结合 · 生成式蛋白质设计

原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.12.757977v1?rss=1