地塞米松（DXE）等糖皮质激素是治疗炎症性肠病（IBD）的一线药物。IBD患者肠道中硫酸盐还原菌脱硫弧菌属（Desulfovibrio）的定植水平也会升高。本研究表明，DXE可通过不依赖代谢的机制调节肠道共生菌脱硫弧菌（Desulfovibrio desulfuricans）的运动性。为鉴定细菌靶标，我们开发了一种源自DXE的化学探针，并进行了基于亲和力的蛋白质分析，结果显示鞭毛帽蛋白FliD（Ddes_0530）是其主要结合蛋白。使用AlphaFold3和Boltz2进行结构建模后，预测DXE可结合于FliD C端结构域的一个保守沟槽内。此外，Desulfovibrio鞭毛尖端可被TAMRA-DXE荧光标记，而大肠杆菌（Escherichia coli）的鞭毛尖端则不能；TAMRA-去甲睾酮也无法实现该标记。这提示DXE在原位可特异性结合Ddes_0530。作为这一相互作用的结果，透射电子显微镜观察显示，DXE处理使一部分脱硫弧菌细胞无法形成鞭毛，并分别缩短了D. desulfuricans ATCC 27774和CCUG 72978菌株的鞭毛长度。定量运动追踪显示，DXE以非单调、剂量依赖的方式调节游动速度，在10 M DXE时刺激作用达到峰值，同时运动轨迹更趋直线，净位移增大。综上，这些发现揭示了DXE此前未被认识的一种作用方式：它可直接干扰IBD患者肠道微生物群重要成员的鞭毛生物发生与运动性。
糖皮质激素地塞米松通过靶向丝状体端帽蛋白 FliD 影响硫酸盐还原菌脱硫弧菌的运动能力 | bioRxiv
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糖皮质激素地塞米松通过靶向丝状体端帽蛋白 FliD 影响硫酸盐还原菌脱硫弧菌的运动能力
Elena Fajardo-Ruiz、Emanuel Kring、Dominik Schum、Sophie Brameyer、Robin Kretschmer、Tao Wang、Joshua Hesse、Isabella Gantner、Emma Weissert、Lisa Goebner、Lucas Milles、Tobias Gulder、Stephan Sieber、Kirsten Jung（查看 ORCID 个人资料）
doi：
https://doi.org/10.64898/2026.07.05.734484
Elena Fajardo-Ruiz¹
慕尼黑大学（LMU Munich）；
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Emanuel Kring²
慕尼黑工业大学（TU Munich）；
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慕尼黑工业大学（TU Munich）；
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慕尼黑大学（LMU Munich）；
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慕尼黑工业大学（TU Munich）；
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Tao Wang²
慕尼黑工业大学（TU Munich）；
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Joshua Hesse³
慕尼黑工业大学（Technical University of Munich）；
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Isabella Gantner¹
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Emma Weissert⁴
马普学会马丁斯里德研究所（MPG Martinsried）；
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Lisa Goebner
5
萨尔大学；
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Lucas Milles
4
马克斯·普朗克学会马丁斯里德分部；
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Tobias Gulder
5
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Stephan Sieber
2
慕尼黑工业大学；
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Kirsten Jung
6
慕尼黑路德维希-马克西米利安大学
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通讯作者：
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糖皮质激素（如地塞米松，DXE）是炎症性肠病（IBD）的一线治疗药物。IBD 患者的肠道中硫酸盐还原菌属 *Desulfovibrio* 的定植也有所增加。在本研究中，我们发现，DXE 通过一种与代谢无关的机制调节肠道共生菌 *Desulfovibrio desulfuricans* 的运动性。为鉴定细菌靶标，我们开发了一种由 DXE 衍生的化学探针，并开展了基于亲和力的蛋白质谱分析，结果显示鞭毛帽蛋白 FliD（Ddes_0530）是其主要结合伙伴。利用 AlphaFold3 和 Boltz2 进行结构建模预测表明，DXE 可结合于 FliD C 端结构域内一个保守的沟槽。此外，*Desulfovibrio* 的鞭毛顶端可以用 TAMRA-DXE 进行荧光标记，而 *Escherichia coli* 的鞭毛顶端则不能；TAMRA-去甲睾酮也无法实现这种标记。这些结果提示，DXE 可特异性结合于】【。
Ddes_0530 原位。作为这种相互作用的结果，透射电子显微镜显示，DXE 处理可抑制一部分菌群形成鞭毛，并分别缩短脱硫弧菌（D. desulfuricans）ATCC 27774 和 CCUG 72978 菌株的鞭毛长度。定量运动追踪显示，DXE 对游动速度具有非单调的剂量依赖性调节作用，在 10 μM DXE 时刺激作用最强，同时运动轨迹更加笔直，净位移也有所增加。综上，这些发现揭示了 DXE 一种此前未被认识的作用方式：它可直接扰动炎症性肠病（IBD）患者肠道微生物群重要成员的鞭毛生物发生和运动能力。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
基金资助信息
德国研究联合会（Deutsche Forschungsgemeinschaft），
https://ror.org/018mejw64，395357507，EXC3092/1-533751719
版权
本预印本的版权归作者/资助方所有；其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。
本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 7 月 7 日。
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糖皮质激素地塞米松通过靶向丝状体帽蛋白 FliD 影响硫酸盐还原菌 *Desulfovibrio desulfuricans* 的运动能力
Elena Fajardo-Ruiz、Emanuel Kring、Dominik Schum、Sophie Brameyer、Robin Kretschmer、Tao Wang、Joshua Hesse、Isabella Gantner、Emma Weissert、Lisa Goebner、Lucas Milles、Tobias Gulder、Stephan Sieber、Kirsten Jung
bioRxiv
2026.07.05.734484；
doi：https://doi.org/10.64898/2026.07.05.734484
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糖皮质激素地塞米松通过靶向丝状体帽蛋白 FliD 影响硫酸盐还原菌 *Desulfovibrio desulfuricans* 的运动能力
Elena Fajardo-Ruiz、Emanuel Kring、Dominik Schum、Sophie Brameyer、Robin Kretschmer、Tao Wang、Joshua Hesse、Isabella Gantner、Emma Weissert、Lisa Goebner、Lucas Milles、Tobias Gulder、Stephan Sieber、Kirsten Jung
bioRxiv
2026.07.05.734484；
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关键词：地塞米松 · 硫酸盐还原菌 · FliD鞭毛帽蛋白 · 鞭毛生物发生 · 细菌运动性
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.05.734484v1?rss=1