内容形式：摘要译文
遗传互作促成表型变异，但大多数研究仅在少数参考遗传背景中对其进行表征，而非在自然群体中开展研究。在线虫（Caenorhabditis elegans）中研究遗传互作，可借助喂食法 RNAi 实现：该方法无需构建单独的突变品系，即可在多种遗传背景中进行基因特异性敲低。然而，在多种 RNAi 条件下逐一筛查数百个分离株，工作量十分繁重。在此，我们开发了一种混合群体分析平台，利用全基因组测序量化数百个遗传差异显著的秀丽隐杆线虫品系在单个培养瓶中的竞争适合度。我们利用该平台评估了一个由 RNAi 敏感型秀丽隐杆线虫品系组成的混合群体对 RNAi 的响应，并鉴定出两类影响 RNAi 响应的数量性状基因座（QTL）。第一类影响针对特定基因敲低的响应，其代表是一个仅与 mig-6 敲低相关的 QTL。第二类则影响对多种基因敲低的总体 RNAi 响应。其中一个 QTL 定位于 III 号染色体右臂，并通过全基因组关联（GWA）和互作 QTL（xQTL）定位均被检出，这表明该 QTL 可能由一个常见的大效应变异所致。我们鉴定出 dsRNA 受体 SID-2 中的 T96K 错义变异为其潜在因果变异。96K 等位基因位于 SID-2 的胞外结构域；与 96T 等位基因相比，该等位基因赋予更高的 RNAi 敏感性。我们推测，96K 等位基因通过与 dsRNA 磷酸骨架进行更高亲和力的结合，使摄入的肠腔内 dsRNA 得以更多地被吸收。我们开发的平台能够以此前难以实现的规模，在自然群体中系统定位遗传互作。
关键词：秀丽隐杆线虫 · RNA干扰 · 遗传互作 · 数量性状基因座 · 混合群体筛选
原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.10.08.757717v1?rss=1